「あんた」や「お前」などをはじめ、個々人の特徴や職業などを基にしたあだ名のような呼びかけもみられる。例えば「巫女」（博麗霊夢、東風谷早苗）や「黒白」（霧雨魔理沙）、「姫様」（蓬莱山輝夜）、「太子様」（豊聡耳神子）などであり、森近霖之助は屋号にも関連して「香霖」とも呼ばれる。単に種族だけで呼称を纏められる事もある（例えば「天狗」や「鬼」など）。

互いに愛称などで呼び合う関係をみても、レミリア・スカーレットとパチュリー・ノーレッジの関係に見る「レミィ」と「パチェ」、地霊殿関係者における「お燐」（火焔猫燐）、「お空」（霊烏路空）など少数である。

翻って、メリーは蓮子に呼びかける際、ほとんど「蓮子」の呼び方を使用している。

さらに思考の中で蓮子の事を考える際も蓮子を指し示す際には「蓮子」として思考している。

また呼びかけの際の文脈上の必要性だけでなく、何気ない言葉の中に「蓮子」の呼びかけを織り交ぜる事も多く、例えば「 ねえ、蓮子 」で始まる声掛けや、言葉の末尾に名前を呼んだりすることも多い。

例えば「夢違科学世紀」における「 これは私の夢の世界の品じゃないの、蓮子 」などで、これらは作中でセリフを介して登場人物の名前や発言者を明確にする意図の文脈以外の機会でも用いられている。

メリーが「蓮子」と呼びかけるのと同様に蓮子もまた「メリー」と呼びかけることが多く、会話や思考を通してもお互いの名前や愛称を通してお互いの事を呼び合ったり考えたりしている様子が描かれている。

メリーからの呼びかけ方

例えば各作品では次のようなケースが見られる。

セリフ・思考文ともにいずれもメリーから蓮子に対する呼びかけである。次のものはあくまで一例であり、各作品ではさらに多くの「蓮子」の呼び方を用いた呼びかけが使用されている。

出典	セリフ例	備考
蓮台野夜行	「蓮子は「蓮台野の入口」って言ってたわ」他	※1
夢違科学世紀	「これは私の夢の世界の品じゃないの、蓮子」他
卯酉東海道	「蓮子は誰かに嘘情報吹き込まれたんじゃないの？」他
大空魔術	「じゃ、不老不死の薬が手に入ったら、蓮子は使うの？」他
鳥船遺跡	「蓮子は怖くないの？」他	※2
伊弉諾物質	「ねえ蓮子。」他
燕石博物誌	「あら、蓮子はそんなことも出来るのね、助かるわー。」他
旧約酒場	「蓮子が見せたかったのはあのお爺さん？」他	※3

※1：メリーの思考の中での呼びかけ

※2：ただし文脈上で一連のセリフの主体者が誰であるかを明確にするための文脈上の演出方法としての呼びかけであると読むこともできる。

※3：セリフではこれのみだが、地の文で思考の中での呼びかけがある。

一方、メリーが蓮子を作中で「蓮子」以外の呼び方で呼びかける機会は次の通りである。

出典	セリフ	備考
蓮台野夜行	（なし）
夢違科学世紀	「貴方に夢の事を話してカウンセリングしてもらわないと」（以下略）
	「だから、貴方に相談してるのよ」
	「貴方みたいな前時代的な人は、」（以下略）
	「そう貴方の眼の様にね。」
	「貴方、そんな獣知らない？」
卯酉東海道	（なし）
大空魔術	（なし）
鳥船遺跡	（なし）
伊弉諾物質	（なし）
燕石博物誌	（なし）
旧約酒場	（なし）

地の文などでの呼び方

先述のとおり、「ZUN's Music Collection」ストーリー部分の地の文でも、二人のフルネームが登場しない「蓮台野夜行」や以後のフルネーム登場する作品での二人を紹介する部分以外でも「蓮子」の呼び方が多用されている。

この他、地の文とは異なるが、作者であるZUNのあとがき部分でも、「蓮子」の呼び方が使用されている（「夢違科学世紀」あとがき他）。

また作中ではメリーからの呼びかけとは明示されていないが、東方Projectにおいて作中登場人物の稗田阿求が著書の「幻想郷縁起」に付録した「 未解決資料 」に「蓮子」という記述が登場している（『東方求聞史紀』）。

これは何者かが「 夢の中 」におり、その様子を後に「蓮子」に話そうとしている様子がメモのような形で残っていたもので、仮にこれがメリーが夢の中で筆記したものだとするならば、こちらの機会においてもメリーは蓮子をその名前で呼びかけていることともなる。

二次創作では

ファンの間や二次創作においても、蓮子を指す場合は「蓮子」の呼び方が主流である。

一方それぞれの二次創作作品中では蓮子がメリー以外のキャラクターと交流する様子が描かれる事もあるため、その際の関係性によっては姓である「宇佐見」の呼び方が使用される事もある。

ただし「宇佐見」に関連しては東方Projectの登場キャラクターとして宇佐見菫子があるため、文脈によって使い分け、あるいは読み手側が読み分ける必要が発生する事もある。

Pixivでは

pixivにおいても蓮子を指し示す場合は「蓮子」または「宇佐見蓮子」の呼び方が多用される。

メリーに関してはpixivの検索システムの都合上、「メリー」のタグ名が「マエリベリー・ハーン」と同一のものとは認識されないために一方だけを使用しているるともう一方が認識されないという検索時の齟齬が発生するというリスクがあるが、「蓮子」は検索方法によって「宇佐見蓮子」を包括し得る。

ただし「蓮子」のタグは先述のように人名・キャラクター名として他の創作作品ともタグ機能を共有するものであるため、登録の際は「宇佐見蓮子」のフルネームを使用するともっとも精度が高く宇佐見蓮子に至る道筋を示す事が出来る。

一方「蓮子」をタグとして使用する際の利便性もある。pixivでは蓮子関連の誤字としての「宇佐美蓮子」（×宇佐美）のタグの使用が一定数あり、そちらのタグのみが使用されている作品もある。これを見るとき、「蓮子」タグを部分一致検索で使用すると「宇佐見蓮子」と「宇佐美蓮子」の両者を包括することができるので、仮に検索側が「宇佐美蓮子」を検索ワードとしていたとしても、その検索が部分一致検索である限りは仕様上両者に対応される。この点では「蓮子」タグはより広義の検索に対応できるともいえる。

タグを使用する際は正確性の観点から「宇佐見蓮子」を使用するのが最も望ましいと思われるが、作品によっては「蓮子」であることに意味があるものやファーストネームだけを用いたいという場合もあり得るため、タグの運用もまた作品の方向性や個々の意向に合わせて柔軟である。

作品を検索する場合では、「宇佐見蓮子」の検索ワードをはじめ「蓮子」の検索ワード、または作品名などを併記したものとしての「東方　蓮子」や「秘封倶楽部　蓮子」などの検索ワードを用いることも選択の一つである。