あらすじ
これから『わたし』がご迷惑をおかけすると思いますけど…… あなたなら…… 『絶対だいじょうぶ』ですよ
クロウカードの収集、及び『最後の審判』を終えたさくらは、クロウカードやケルベロス、もう一人のカードの守護者・月の新たな主となり、普通の生活に戻った。
そんなある日、さくら達のクラスにイギリスからの転校生・柊沢エリオルが現れる。彼が転校してきたその日の夜、局地的な大雨が町に降ってきて、さくら達はその原因を探ろうとする。
さくらはクロウカードを使用するが、今までの魔法は全く通用せず、ケルベロスや月も身体を動かせなくなった。ピンチに陥ったさくら達だが、その最中、さくらは新たな力に目覚め、見事に雨を止めさせた。同時にクロウカードはさくらの魔力でさくらカードに創り変えられ、ケルベロス達は雨の原因に亡くなったはずのクロウ・リードの気配を感じ取る。
新たなカードを手に、さくらはカードキャプターとして、次々に起こる不思議な事件に立ち向かっていく。