全農は北海道を除く日本全国の農業協同組合・経済農業協同組合連合会（経済連）・専門農協の連合会（専門連）などの連合組織。北海道の連合組織はホクレン農業協同組合連合会であり、農林中央金庫 （農林中金)、全国共済農業協同組合連合会（JA共済連）などと併せてJAグループを形成している。
1948年（昭和23年）に全国農業会を解散・全販連（全国販売農業協同組合連合会）・全購連（全国購買農業協同組合連合会）を設立。
1972年（昭和47年）全販連と全購連が合併し・全国農業協同組合連合会が設立。1977年には全国4,329農協が全農への直接加入を実現。
全農は国の外郭団体ではないが、国策団体だった全国農業会を前身としている関係上政府との関係が深く、農水省の支援窓口として国の農政の補完的な役割を果たしてきた面が強い。しかし近年は政府との関係がぎくしゃくしており、国の掲げる自由化政策と対立することが増えている。2016年には政府から「農薬などの資材を農家に売る事業からの撤退」や「農産品の委託販売の廃止」などの組織改革を早期に行うよう迫る提言があり、結局、全農による自主的な組織刷新を行うという自民党の農業改革案が了承されている(民間団体でしかない全農に対し、政府による介入は本来は筋違いなのだが、国との関係を決定的に悪化させたくないという判断で拒否できなかった模様)。
PR活動
2014年1月から2016年まで全農が国産肉PRのためアニメ『おにくだいすき!ゼウシくん』を製作した。TVCMやyoutubeで配信されている。⇒公式サイト
2017年放送のアニメ『アイドルタイムプリパラ』の主人公・夢川ゆいは作中で「米が大好物」と言う設定だったことから、全農より「お米応援大使」に任命されていた。
2023年放送のアニメ(『百姓貴族』ではJAグループのJA全中(一般社団法人 全国農業協同組合中央会)が農業監修を担当している。
