概要
軽種馬（サラブレッド）生産者による社団法人サラブレッド協会をルーツとし、馬産地の保護と外国の優れた種牡馬や繁殖牝馬を導入して日本産馬の価値を高め、海外へ輸出することを目的としている。
競馬情報データベースのJBISサーチは日本軽種馬協会が運営している。
種馬事業
全国の主要な生産地に3か所の種馬場を設置して事業を展開する。協会所有種牡馬の種付料は格安。
●静内種馬場：北海道日高郡新ひだか町（1963年開設）
●七戸種馬場：青森県上北郡七戸町（1962年開設）
●九州種馬場：鹿児島県曽於郡大崎町（1964年開設）
沿革
| 1946年 | 「社団法人サラブレッド協会」として設立。 |
| 1947年 | 北海道・東北・栃木・下総・九州各支部を設立。 |
| 1948年 | 「軽種馬生産農業協同組合」に改組。 |
| 1955年 | 「社団法人日本軽種馬協会」に改組。 |
| 1968年 | 種牡馬ハクチカラをインド、カネチカラをマレーシアへ寄贈。 |
| 1976年 | 七戸種馬場で提供されていたインターメゾの産駒、グリーングラスが菊花賞で勝利。 |
| 1980年 | 英国サラブレッド生産者協会に加入。 |
| 1981年 | 国際招待レース「ジャパンカップ」を創設。 |
| 1997年 | 協会初のシャトル種牡馬としてロドリゴデトリアーノがニュージーランドへ。協会所有種牡馬ロイヤルスキーの産駒、ワカオライデンが地方競馬リーディングサイアーとなる。 |
| 1999年 | ワカオライデンが地方競馬リーディングサイアーとなる。 |
| 2000年 | 協会所有種牡馬オペラハウスの産駒、テイエムオペラオーがJRA年度代表馬・JRA最優秀5歳以上牡馬となる。 |
| 2001年 | 協会所有種牡馬ダンシングブレーヴの産駒、テイエムオーシャンがJRA最優秀3歳牝馬となる。 |
| 2005年 | 協会所有種牡馬デヒアを、クールモア所有のストラヴィンスキーと交換。 |
| 2006年 | 協会所有種牡馬オペラハウスの産駒、メイショウサムソンがJRA最優秀3歳牡馬となる。 |
| 2007年 | 下総種馬場での種馬業務を中止。 |
| 2012年 | 「公益社団法人日本軽種馬協会」に改組。 |
| 2015年 | 協会所有種牡馬カリズマティック産駒、ワンダーアキュートがかしわ記念で史上最高齢（9歳）でのJpnⅠ勝利。 |
| 2020年 | 協会所有種牡馬バゴの産駒、クロノジェネシスが宝塚記念・有馬記念を制し、同一年春秋グランプリ制覇を達成。 |
