2000年12月1日に放送を開始した衛星基幹放送事業者。フジ・メディア・ホールディングスの子会社で社長もフジテレビ出身者が務めている。
民放BS放送局で一番最初に黒字を達成しており、この勢いは2015年以降に親元が視聴率・業績ともに大きな凋落に見舞われている中でも決して業績を下げること無く続いている。
また2017年以降、BSフジの番組を遅れネットする地上波ローカル局が増えている。
アニメ事情
海外アニメをメインに、フジテレビ製作アニメのうち「ONE PIECE」と「ドラゴンボールZ」、さらには「暗殺教室」やUHFアニメのごく一部を放送している。なお、その忌まわしきUHFアニメ放送第1号は2010年4月から10月まで放送された「天体戦士サンレッド」だったりする。また、かつてはノイタミナも放送していた。
UHFアニメの放送数は在京キー局系BS放送局では第4位と少ないが、深夜・全日枠問わずアニメ枠を（原則）全廃したBS朝日を追い越す可能性がある。しかも「スペース☆ダンディ」や「それが声優!」や「赤髪の白雪姫」など、製作委員会に首を突っ込んだ作品すら存在する。
2017年4月から、月曜日と火曜日の深夜0時台を「アニメギルド」と銘打ち、UHF深夜アニメを放送する枠と定めている、つか、いつの間にか水曜と木曜の深夜0時台前半とか土曜深夜2時台後半にまで増殖しちゃってるんですけど･･･････････。どうしてこうなった。
なお、2016年秋アニメにて、TOKYOMXで放送された「学園ハンサム」を放送していたが、これは「学園ハンサム」の放送時間が5分間で、TOKYOMXの番組を放送しているBS11ではタイムテーブルにズレが生じることから、放送局の変更があったものと思われている（BSフジの場合、深夜帯はほぼ通販CMを放送していることや、前の時間帯に放送されている番組の時間変更という事もあるので、そこで柔軟な対応ができている）。
アニメ以外の番組
日本の無料放送局で唯一「トップ・ギア」を放送している。ただし完全版ではなかったので、完全版を見たければイギリスへ移住しなければならなかった。
その他代表的な番組は以下のとおり
放送中
- 所さんの世田谷ベース
所ジョージの冠番組。所ジョージのアドリブだけで番組が進行するという非常に先進的な内容。
- BSフジLIVE プライムニュース
フジテレビ報道局制作番組。毎週月曜から金曜まで放送されている大型討論番組で、地上波フジテレビ系で放送されている「新報道2001」と同様に、与野党の幹部クラスも生出演する。
- Beポンキッキ
2007年に地上波での放送を終了したポンキッキの後継番組。きかんしゃトーマスシリーズは放送権を版権元に返還したため、「ひらけ！ポンキッキ」時代のように番組内で放送されていない。
- BSフジニュース
FNN製作のニュース番組。番組と番組の間、5分間程度で放送されている。
- クイズ!脳ベルSHOW
脳の回転を高めるための番組、というのがコンセプトだが、「年を取ると脳の機能が損なわれる」といわれるからか、解答者は全員40歳以上というクイズ番組。司会は岡田圭右。タイトルに「ベル」が織り込まれているのは、「お前の脳は大丈夫か?」と警鐘を促す、つまりベルを鳴らすというシャレから来ている。最近テレビでは見かけない懐かし有名人が解答者として多数登場する。週1回（水曜22時台）でスタートしたが、帯番組になり週5回（平日22時台）も放送する、ばかりか、フジテレビ（関東地区ローカルではあるが）でも日曜－木曜28時～28時55分に放送している。
1988年の同名の小説を原作としたアメリカのターナー・ネットワーク・テレビジョンが企画制作する海外ドラマ。国内ではBSフジが独占放送している。
- アニソンCLUB!
アニメソングを専門に扱う音楽バラエティ番組。TOKYOMX制作。元はMAGES.が運営する「animeloLIVE!」にて、2014年6月から会員限定配信を開始したインターネットテレビ番組だったりする。
- ジャパコンTV→ジャパコン★ワンダーランド
アニメ・ゲーム・漫画・ファッションといった、日本を代表するサブカルチャー「ジャパンコンテンツ（ジャパコン）」に関するテーマを複数取り上げた情報番組。
放送終了
- 鉄道伝説
日本の鉄道史で伝説に残る車両や列車などを特集したドキュメンタリー番組。公式ブログは一読の価値あり。
- 旅するハイビジョン 全国百線鉄道の旅
鉄道旅番組。毎月1回日曜日に放送されていた。
- アニソン・ハンター
アニソンCLUB!と同じアニメソング専門音楽バラエティ番組。エイベックスが製作に一枚かんでいが、エイベックス以外の音楽ソフトメーカーに所属するアーティストも出演した。ナビゲーターは浅沼晋太郎、芹澤優、坂本英三。
