ダチョウ目は古顎類の内、飛翔能力を失い竜骨突起の喪失したもの（平胸類）を便宜上まとめたものとなっており、飛翔能力を持つシギダチョウ目（深胸類）は、古顎類で唯一ダチョウ目から外されている。
しかし、分子系統による解析で、ダチョウ目は多系統群であり、竜骨突起の喪失は平行進化だと見られている。
広義のダチョウ目が側系統だと判明したため、近年は古顎類をダチョウ目・レア目・ヒクイドリ目・キーウィ目・シギダチョウ目の5目に分ける分類が標準になりつつある。
― レア目
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｜― シギダチョウ目
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｜ ｜ ― ヒクイドリ目
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｜ ― キーウィ目
古顎類―｜
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― ダチョウ目
