ピクミンシリーズの2作目。2004年にゲームキューブソフトとして発売され、2009年にはWii版も発売された。ゲームキューブ版はカードe+に対応している。モードはストーリーとチャレンジモード、2Pバトルの3つ。ストーリーは1人用、2Pバトルは2人用。チャレンジモードは1人、2人どちらでも遊べる。(チャレンジモードのスコアは1人プレイと2人プレイで別々に記録される)

前作のタイムリミットは30日だったが、今作では日数制限はない(ゲーム内での設定では生命維持装置のバッテリーを大量に持ち込んでいるとお宝のひとつである「メニドクダケ」のメモで確認できる。恐らく前作での経験と反省、及び長期の探検を予想をしての為と思われる)。また、全てのお宝を回収し、エンディング後もそのままゲームを続行できる（前作、次作はエンディング後のデータで遊ぶことはできない）。

数々の新要素によって前作の何倍にも拡張されたボリュームや絶妙な難易度調整、二人での対戦や協力プレイの導入などによって、シリーズ最高傑作との呼び声も高い。

一方、シリーズ中でも地下洞窟の構造やお宝の配置などのランダム性、運要素が特に激しく、RTAなどの競技プレイでも好記録を出すには膨大なトライ＆エラーが前提となる。

本作の『お宝』は我々にとって身近な小道具やガラクタが主だが小人サイズのホコタテ星人の目線では全く違う物に見えている。

初心者向けの難易度、やり込み要素の拡充などから前作より完成度が高まったが、テレビCMやCMソングの認知度が低く、メディアで目立たなかったことから売上は『1』より微減していた。

2023年6月22日には『Pikmin 1+2』として前作と共にswitch移植版が配信され、同年の9月22日にはパッケージ版が販売された。

本作で収録されているのは日本版2ではなく海外版2を日本語訳したもので、タイトルなどいくつかの細かな仕様が海外版準拠になっている他、お宝「謎エネルギーシリーズ」「収納王シリーズ」「謎の円盤郡シリーズ」の一部が変更されている。これは日本版海外版共に登場するお宝のいくつかがタイアップにより実在する物である為、それらとの権利などの関係から架空の物に変えられたのだと思われる(なので、以降に移植される際にはこの『1+2』バージョンで統一になる可能性が高い)。

ちなみにローカライズの都合により海外版2の時点で既に日本版2からいくつかお宝が変更されていたのだが、『1+2』ではそこから更に変更されたお宝もある。例を上げると、日本版2では「あいとゆうきリアクター」＝「National Hi-Top電池」だったお宝は海外版2では「Duracell電池」になっていたのだが、switch移植版ではどちらでもない架空の電池になっている。