話数	サブタイトル	備考（元ネタなど）
第1話	これが始めのストライク！
第2話	指でヒッパレ！オラゴン！
第3話	水澤葵の秘密
第4話	真夜中のモンストコロシアム
第5話	ショッピングモールの決闘！
第6話	閃光の刃
第7話	影月明勧誘計画
第8話	邪眼でも若葉皆実だぞ！
第9話	葵の恥ずかしすぎる動画！
第10話	商店街戦線異状なり
第11話	皆実、仲間入ったってよ	由来は恐らく映画化もされた桐島、部活やめるってよ
第12話	オラゴン危機一髪	黒ひげ危機一発のパロ？
第13話	超絶降臨
第14話	イザナミ死す	由来は恐らく城之内死す。
第15話	闘神降臨	本編から第二章に突入。
第16話	反攻のストライクショット
第17話	記憶の秘密
第18話	春馬を探せ
第19話	残滅のルシファー
第20話	光るストライクリング
第21話	きたれ！モンスト部
第22話	秘剣！桜吹雪
第23話	天邪神ダークゼウス
第24話	森の歌姫リボン
第25話	炎の闘神ニルヴァーナ
第26話	アスに向かって撃て！
第27話	ゲスなダブルデート
第28話	再び渋谷へ
第29話	アリス・イン・マッドランド	元ネタはアリス・イン・ワンダーランドか。
第30話	神託の巫女
第31話	神の刃と悪魔の銃口
第32話	先のバハムート
第33話	不滅のドラゴンスピリット
第34話	龍馬VSルシファー
第35話	死を思え	龍馬獣神化　謎のカウントダウンの正体は龍馬獣神化のカウントダウンだった
夏スペシャル	マーメイドラプソティー	キスキル・リラが関わる長編エピソード
第36話	彼岸花の牢獄
第37話	黒の坂本龍馬
第38話	Kの真実
第39話	明と春馬
第40話	結成！リボン親衛隊？
第41話	XFLAG PARK
第42話	八雲立つ逢魔の夜
第43話	八岐ノ森の贄比女
第44話	古き世界の終わり
第45話	封印の破壊神バベル
第46話	白衣の天使、降臨
第47話	混沌のジグラート
第48話	オルタナティブドラゴンの記憶
第49話	光の闘神カルマ
第50話	神の光、神の炎
最終話	終わりと始まりのストライクショット
スペシャル	レイン・オブ・メモリーズ	映画公開記念スペシャル
続・最終回	パンドラの箱

セカンドシーズン

前編(エナジーポイント解放編)

話数	サブタイトル	備考（元ネタなど）
第0話	渇望の果ての理想郷	前夜祭スペシャル　本編からセカンドシーズンに突入
第1話	転校生は超絶級？
第2話	穢土に轟く忿怒の業拳
第3話	ワルプルギスの夜	ワルプルギス激獣神祭で登場
第4話	焼き鳥・男気・冒険王
第5話	炸裂！セブンス・ギャラクシー
第6話	温泉、それは聖なる癒し
第7話	美人天使の湯けむり事件簿
第8話	斑目CEO
第9話	争いの無い世界
第10話	森羅万象の特異点
第11話	占い師も困惑！エナジーポイントは何処に？
第12話	恐怖の大王
第13話	大預言者ノストラダムス	ノストラダムス超獣神祭で登場
第14話	輪廻へ導く菩提樹の仙峡
第15話	それぞれの思い
第16話	森の英雄ロビン・フッド
第17話	永久を夢む女神
第18話	ツクヨミVSツクヨミ零
第19話	女海賊アルビダの奮闘
第20話	神殺しの提督ネイヴィス	新ガチャ「大海賊クロニクル」スタート
第21話	黒髭ティーチの企み
第22話	媽祖の真実
前編最終話	最後の番人	ここで一旦2ndシーズン終了　2ndシーズン第23話

後編(消えゆく宇宙編)

話数	サブタイトル	備考(元ネタなど)
第1話	終わりの始まり	2ndシーズン「消えゆく宇宙編」スタート　2ndシーズン第24話　ミロク激獣神祭にて登場
第2話	圧倒的な力の差！立ちふさがるミロク
第3話	明かされるマナの真実
第4話	マナを救え！それぞれの決意
第5話	死の國の刺客、黄泉
第6話	ルシファーVS黄泉
第7話	敵はマナ・アニマ
第8話	我が成すことは我のみぞ知る
第9話	死闘龍馬とミロク死闘
第10話	龍馬、命を燃やして
第11話	情愛の天使マナ
第12話	宇宙に消えゆく	マナ超獣神祭で登場
後編最終話	残されたもの