2面4線の島式ホームを有する地上駅。駅舎とホーム間の移動には跨線橋を利用する。また、1番線と6番線は留置線となっている。社員配置駅（みどりの窓口：朝晩は無人）・自動券売機と、飲食店として立ち食いそば・うどん店を設置している。改札外に男女別の水洗式便所がある。ジェイアール北海道レンタリース（駅レンタカー）富良野営業所を併設している。
2024年(令和6年)4月1日に根室本線の富良野駅〜新得駅間が廃止された為、道内では石北本線遠軽駅同様に頭端式ホームの駅となった。その為当駅を終着とする列車は全て下り列車、当駅を始発とする列車は全て上り列車である。
