初参戦の『DX』では、その解禁条件が「対戦のべ時間が20時間を超える」か「対戦ゲームの試合を700回おこなう」という骨の折れるものであった。もっとも「のべ時間」というのはすべてのプレイヤーの合計なので、「時間無制限・アイテムスイッチをボム兵などの自動攻撃判定発生アイテムをオフ・ステージをポケモンスタジアムなどの強制スクロールとダメージギミックなしのステージ・プレイヤー4人全員を人間操作」に設定して対戦画面放置で5時間で解禁する事は出来た。

とはいえ、コントローラーを1つしか持ってないプレイヤーにとっては上記の通り骨が折れるようないばらの道であることは確かであり、当時はミュウツー解禁のためにコントローラーを買ったというプレイヤーもいたとか。

1番手っ取り早いのはガノンドロフを先に解禁して

『体力制乱闘で軽量級キャラを魔神拳の1撃で倒す』事だろう。

声優は『ミュウツーの逆襲』と同じく市村正親。

映画とは違い声に加工が加えられているが、星になったときはアニメのイメージからは想像できない拍子抜けした悲鳴が聞ける。

「体重が軽い」と前述したが、『DX』ではマルスより若干軽い程度で、自身よりもさらに軽い……というか軽すぎるファイターが多かったため、どちらかといえば中量級に属するファイターだった（平均90に対しミュウツーは85）。

ただし落下速度が遅いため、上方向にふっとばすワザに対して弱い。

シリーズ初の追加コンテンツとして復活した『for』では、諸々の事情で市村を起用できなかったらしく、藤原啓治が声を引き継いだ。

声の加工が行われているのは『DX』と同様だが、声質や演技は市村に寄せている為、うまく役にハマっており、違和感は無い。

アップデートで最も多くの強化を得たファイターの一角。

機動力の大幅な上昇（特に歩行速度・走行速度は1.2倍に）をはじめ、横スマ根本・空上のダメージ増加、空上のふっとび増加、空前の発生高速化、上スマの後隙減少、空下の持続増加、横スマ・空N・空後・空上の判定拡大、空中攻撃の着地隙減少…と、目に見えるほどにパワーアップを果たしている。

しかし、弱点の一つである体重の軽さが大幅に悪化（72）し、なんとプリンに次いで軽くなった。身体の大きさも相まって、防御力は事実上の最下位。

Ver.1.1.5で若干重くなったものの、それでもMr.ゲーム&ウォッチより軽い（74）。

『SP』ではどちらかといえば弱体化された部分が多い。

比較的目立つ部分としてはつかみ攻撃が電撃属性から暗黒属性に変更されたことと、尻尾の喰らい判定が先端近くまで拡大されたこと、体重が増えたこと（77→79）あたりか。

その他

イベント戦

『DX』の「ホントの最終決戦」では、ミュウツーがガノンドロフやギガクッパと組んで登場する。

ミュウツーは遠距離からシャドーボールを撃ってくる妨害がかなり鬱陶しい存在となる。他の2人が近距離メインなのに対し、ミュウツーは遠距離で援護してくるのが特に厄介。ギガクッパが大きすぎて気づきにくいのもポイント。かといってミュウツーばかり気に取られてると、超火力のガノンドロフ、そしてギガクッパの餌食となる。

このイベント戦をクリアすると終点が解禁される為、なんとしてでも倒したい。

勝ちあがり乱闘「洗脳による支配」

ROUND	敵	味方（カラー）
1	ネス、リュカ	（なし）
2	クラウド	リュカ（5P）
3	リュウ、ケン	クラウド（2P）
4	リヒター	ケン（2P）
5	パルテナ、ピット	リヒター（7P）
6	ピカチュウ、ピチュー、プリン、ルカリオ	ピット（6P）
BOSS	マスターハンド&クレイジーハンド	ピカチュウ（2P）