それまで原作付きのアニメは原作を改変するのが当たり前という風潮が見直され、原作に忠実なアニメ化が増えるきっかけとなったといわれているのもこの作品。というのも2005年と2006年にTVアニメ化されたが、どちらも内容は原作から大きく改変されており、特に一期は熱心なファンを失望させる内容だったからだ。詳しくは後述。

テレビアニメ1期

2005年1月5日から同年6月29日までテレビ東京系で放送。アニメーション制作はXEBEC。全26話。

連載開始から程なくしてアニメ化が決定し、2004年中に行われたイベントにおいてパイロット版が上映（パイロット版はCD「学園生活を快適にすごすシリーズ」にDVDで収録）。ただし、監督はパイロット版を担当した錦織博に代わり、宮崎なぎさが担当。脚本は大河内一楼が全話担当。

しかし序盤から作画崩壊が頻発し、原作者すら、自身のホームページの日記においてアニメの出来を批判するほどであった。

第13話で宮崎が監督を降板し(スターチャイルド側でも大月俊倫が本作企画より降板)、以降は羽原信義が事実上の新監督となってスタッフの大幅な入れ替えをしたことでで作画の乱れは多少改善されたものの第22話以降はオリジナル展開になり、特に第23話では明日菜が14歳の誕生日とともに死亡し、続く第24話で火葬シーンが描かれたことで、多くのファンにトラウマを植え付けた。

その一方、主題歌「ハッピー☆マテリアル」のCDや、DVDなど関連グッズの売り上げは好調で、翌年の『ネギま!?』の製作に繋がった。

原作漫画との相違点

このせつプッシュが多く、第1話では原作漫画ではなかった近衛木乃香と桜咲刹那の会話シーンが追加されたり、修学旅行編では原作では『フェイトの石化魔法を受けて徐々に石化していくネギを救うべく、木乃香がネギとキスして仮契約してネギを救う』というシーンが、『木乃香を救うべく瀕死になってしまった刹那を救うべく、木乃香が刹那とキスする』に変更されるという賛否両論とも取られかねない大幅なアレンジがされていた。

原作初期に顕著だった学園ものとしての色合いを強調した反面、バトルシーンはかなり抑えられ、特に原作では半年以上を費やして描かれた「修学旅行編」がわずか2話で消化されている。

ネギが赴任した時期が2年生の4月に繰り上がっている。

放送当時まだ魔法世界関係の設定が固まっていなかったこともあり、明日菜が「完全魔法無効化」能力を得たのは4歳の頃に魔族に契約されたのがきっかけになっている(これが死因でもある)。

テレ東規制により、パンチラなどのお色気描写は少なめ。

主題歌

オープニングテーマ

「ハッピー☆マテリアル」（第1話 - 第23話・第25話・第26話）

作詞：うらん / 作曲：大川茂伸 / 編曲：大久保薫 / 歌：麻帆良学園中等部2-A

エンディングテーマ

「輝く君へ」（第1話 - 第13話・第26話）

作詞：ヌマダテゆか / 作曲：桑原秀明 / 編曲：桑原秀明（第1話 - 第13話）、光宗信吉（第26話） / 歌：麻帆良学園中等部2-A

「おしえてほしいぞぉ、師匠」（第14話 - 第22話・第24話・第25話）

作詞：くまのきよみ / 作曲：大久保薫 / 編曲：鶴由雄 / 歌：麻帆良学園中等部2-A 師匠となやめるオトメ組

各話リスト

話数	サブタイトル	主なエピソード・トピックス
1	Asinus in cathedra	ネギ、麻帆良学園に赴任
2	Omne initium est difficile	ネギ、明日菜と木乃香の部屋に住むことに
3	Amantes, amentes	ネギが明日菜に惚れ薬を飲まされる
4	Nullus est instar domus	女子寮大浴場騒動　本放送と映像ソフトとで次回予告の内容が異なる
5	Fama volat	カモ初登場
6	A fronte praecipitium a tergo lupi	ネギVSエヴァ、初戦
7	Fallaces sunt rerum species	ネギが楓と特訓
8	Omnes una manet nox	ネギVSエヴァ、決着
9	Te capiam, cunicule sceleste!	鳴滝姉妹がネギを学校案内する
10	Ubi concordia, ibi victoria	聖ウルスラ女子高等学校とのドッジボール戦
11	Cum tacent clamant	長谷川千雨(ちう)回。原作者の赤松健がゲスト声優として出演
12	Aut disce aut discede	期末試験・図書館島へ(前編)
13	Tamdiu discendum est, quamdiu vivas	期末試験・図書館島へ(後編)。宮崎なぎさ監督降板
14	Amicitiae nostrae memoriam spero sempiternam for	ED変更　ネギと木乃香のショッピング
15	Amicus certus in re incerta cernitur	ネギと2-Aの皆があやかの実家に訪問
16	Amor tussisque non celantur	ラブラブキッス大作戦(枕投げ)回。
17	Nihil difficile amanti	ネギとのどかの遊園地デート
18	Amor ordinem nescit	羽原信義がチーフディレクターに就任。明日菜が高畑先生のためにケーキを作る。
19	Verba volant, scripta manent	相坂さよ回
20	Nisi credideritis, non intelligetis	京都修学旅行(前編)
21	Nil desperandum!	京都修学旅行(後編)
22	Difficile est tristi fingere mente jocum	アニメオリジナル展開に突入
23	Memento mori	明日菜死亡　EDはハッピー☆マテリアルのインストゥルメンタル
24	Et arma et verba vulnerant	明日菜火葬　OPなし
25	Mors certa, hora incerta	ネギが過去にタイムスリップし、ナギと対面
26	Non mihi, non tibi, sed nobis	魔将軍との最終決戦　2-A生徒全員がネギと仮契約する