概要
5巻にて初めてその存在が示唆された精霊と思しき謎の存在。なお〈ファントム〉とは初めてその存在が発覚した際、〈ラタトスク〉側が便宜上命名した識別名である。
輪郭があいまいでノイズにしか見えず『何か』としか形容しようのない姿(美九曰く存在そのものにモザイクが掛けられているような感じとの事)をしており、何だかの思惑があるらしく、言葉巧みに琴理や美九、さらには5年前に時間遡行して攻撃を仕掛けてきた折紙が自らに反逆することをわかっていながら語り掛け、“霊結晶”を渡し、精霊としての力を与えたり、精霊としての力を与えた琴理を使い何だかの実験を行う、狂三に精霊の力を宿した士道の情報を与え彼と接触するように仕向ける、など様々な場面で暗躍している。
そのほか5巻と6巻の間を描いたゲーム「凛祢ユートピア」のトゥルーエンディング（真エンド）にて、どこでもない空間で消えゆく凛祢に接触し「お疲れ様、あなたの役目は終わったわ」というセリフを彼女に投げかけている事から、彼女も何らかの形で〈ファントム〉の目的に協力（士道を死なせないように守ること？）していた可能性があるが詳細は不明である。
今の所、霊装や天使の能力などは一切不明だが、対象者の心の中や頭の中をのぞくことが出来るような描写や記憶の封印、そして常に自らの存在を隠蔽し続けているノイズをかけているなど、その能力の一端らしきものを垣間見せており、その他、狂三に士道の能力の詳細を教えたり、彼女しか知らない〈刻々帝（ザフキエル）〉の【一二の弾（ユッド・ベート）】の力を知っていたり、〈凶禍楽園（エデン）〉が消滅したため、どこでもない空間で消えていき存在そのものが忘れ去られたはずの凛祢の記憶を保持していたり等々その正体及び目的には謎が多いが、少なくとも物語が始まる5年前に起きた折紙の両親の死について何だかの形で係っていることは確かなようで、士道はこの<ファントム>こそが折紙の両親を殺害した真犯人ではないかと疑っている。だがその真実は……。
折紙に禁断の果実である“霊結晶”を渡す際、誰にも悟られず渡していることから、どこか異空間に身を潜めている可能性が示唆されているが詳細は不明。
また、今までの少ない情報から推測するに、1巻で士道に語り掛けてきた謎の女性やアイザックが仄めかしていた今まで物語で起きた事件の元凶となった存在の女性との関連性が疑われるが、現時点では不明。
5年前に時間遡行し、〈ファントム〉に攻撃をしかけた折紙によって剥ぎ取られたノイズの下は髪の長い少女の姿をしており、その声は折紙が知っている何者かである模様。
なお、10巻で自身の願いを叶えるために、強大な精霊を産み出しているらしい事(そのため折紙が自分に反逆した時は驚きつつも歓迎しているような素振りを見せている)や何だかの理由で力を欲している女性たちに、人間に精霊の力を授ける禁断の果実たる“霊結晶”を渡しているようだが…?
よってその正体や目的が判明するには話が進むのを待つしかない状態だが、少なくとも物語の重要な秘密を知っているのだけは間違いないようである。
