概要
シャーロック・ホームズとともに、メアリ・モースタンと結婚(「四つの署名」)まで221Bに同居し、生活をしていた。
元軍医で第二次アフガニスタン戦争で、肩(足という説もある)を負傷し、本国へ送還されたあと、スタンフォードに紹介され、シャーロック・ホームズとの生活に至った。
ホームズ専属の伝記作家である。
結婚後、開業医になっている。
人物像
ホームズと対比された形で描かれており、安定した仕事を持っている常識人というイメージが文章からは読み取れる。
また、本人は女性好きを自称しているが、そういった点が物語自体に現れている部分は見られない。
作中の不明点
・戦争から送還された理由の負傷箇所は、足という説と肩という説が挙げられる。
・ジョン・H・ワトソンのHは、ヘイミッシュとの説が有力ではあるが、不明。
・メアリーとは、離婚説・死別説とがある。
のちの解釈
BBC制作のSHERLOCKでは、マーティン・フリーマンが演じ、名前はジョン・ヘイミッシュ・ワトソンとなっている、また負傷した箇所は肩で、足は心因的な理由でPTSDと設定されており、原作の矛盾点を双方とも盛り込んだ設定になっている。