概要
「ポケモン不思議のダンジョン」の世界は通常のポケモンシリーズとは異なり、地方名などが判明していない。
そして、各スポットがダンジョンという形で登場する。
救助隊シリーズ（赤・青）
ポケモンひろば
- きゅうじょきち
主人公たち救助隊の拠点。
ベッドで休むとゲームのセーブができる。
後に救助基地作成イベントが発生。（外観については自分で確かめてみよう。）また、ある依頼をこなせばドーブルが基地にある旗の模様を変更してくれる。
- カクレオンしょうてん／カクレオンせんもんてん
カクレオン兄弟が営むお店。
ポケ※を払うと彼らの売る商品が買え、こちらがダンジョンで拾った道具を売ればポケに変えてくれる。
左の兄（緑）はきのみやタネなどの食糧、装備品などの必需品を売っている。
右の弟（紫）はふしぎだまやわざマシン。一度使用するとなくなるがその分効果の高いものを売っている。
（※この世界のお金はポケと呼ばれる。
手に入れるにはダンジョン内に落ちているものを拾うか、救助成功の報酬として受け取る必要がある。）
また、ポケダンシリーズ最強のポケモンでもある。
- ガルーラのそうこ
ガルーラが営む倉庫。道具が預けられる。
ポケダンシリーズで最もお世話になるといっても過言ではない偉大な倉庫。また彼女を元にした像があり、これによりダンジョン入り口では道具の交換とセーブが、中間地点ではセーブが可能になる。
通信を行いアイテムを交換するさいにも使用する。
- ペルシアンぎんこう
ペルシアンが営む銀行。女性。
ポケを預け入れ、引き出しするのに使用する。
最大9,999,999ポケまで預ける事ができる。
- プクリンのともだちサークル
プクリンが営むともだちエリアが購入できるお店。（男性。ここの主人は妖精のようなお方。）
「ともだちエリア」とは、
【ダンジョン内で出会ったポケモンを仲間（以後ともだち）にスカウトする為に必要になる土地の総称。】
第1シリーズ特有の設定。ともだちエリアがないとダンジョン内で出会ったポケモンをともだちにすることができない。この場所を買うことにより初めてともだちの生活の基盤を獲得することができるのだ。
（例、初めての依頼をクリアした主人公たちが出会うコイルは、後にパートナーに救助隊の仲間に誘われるがともだちエリアがなくその場は断った。
しかし本心では救助隊に入りたいと思っていた彼は翌日プクリンに自身のともだちエリアを開いて欲しいと頼み込む。プクリンこれに大サービス。コイルはともだちエリア「むじんはつでんしょ」を獲得、遂に彼は主人公たちの最初のともだちになったのだ。）
また、ともだちエリアを買うと行けるようになるダンジョンがあり、その場のみいるポケモンも存在する。さらにED後には、伝説のポケモンに関する新しいストーリーが始まるなど。
以上の理由から、集まったポケは最初にともだちエリアを買うことに使用することを強くオススメします。
- ゴクリンのれんけつてん
ゴクリンの営む技専門店。男性。
技の連結と分解、そして思い出しが可能。
技の連結とは、二つ以上ある技から連結を登録する。その技が上から順に繰り出されるようになること。
これは違う！と思ったら分解。あれが使いたい！となったら思い出し。そうして自分だけの技のオリジナルコンボを見つけ出し、楽しむこと。
これがポケダンシリーズのやり込み要素の一つです。
- ペリッパーれんらくじょ
名前の通りペリッパーたちが運営する連絡所。
通常、困ったポケモンが助けを求め救助依頼の手紙がペリッパーに届きます。彼らが仕分けして掲示板に載せた依頼を救助隊は選び助けに行き、そして解決します。最後に依頼者から救助成功の報酬が贈られます。
この一連のやり取りが行われる場所です。
ここでは他に通信を行うことにより倒れた相手プレイヤーを助ける「ともだちきゅうじょ」や、トップメニューを開きパスワードを打ち込むことで特定の依頼を受けることができる「ふしぎなメール」などがある。
- マクノシタくんれんじょ
ひろばの南の外れにある、全3Fのダンジョンを攻略する修行を行える訓練所。
出現するダンジョンについては下記を参照。
男性。彼の人望は中々厚いようで、後述するダンジョン内のポケモンは全てボランティアで手伝ってくれているらしい。（いつもありがとう。）
- ナマズンのいけ
ひろばの北にある美しいいけ。その名の通りナマズンがいる。このいけの大きな特徴は下の項目にある。
- ひかりのどうくつ
ナマズンのいけの足元に突如生まれた洞窟。ED後に行ける進化を行える場所。こちらも下記参照。
- ゴンベ
ED後に出てくるゲストキャラクター。下記参照。
不思議のダンジョン
(本編)
- ちいさな もり
- でんじはのどうくつ
- ハガネやま
- あやしい もり
- ちんもくの たに
- ライメイの やま
- おおいなる きょうこく(※1)
- ぐんじょうの どうくつ
- ほのおの やま
- じゅひょうの もり
- ひょうせつの れいほう(※2)
- さわぎの もり
- マグマの ちてい
- てんくうの とう
- とおぼえの もり
※1 ネイティオの棲みか「せいれいの おか」があり、彼は一日中太陽を見ることで未来をも予言する。
※2 主人公たちが各地を訪れるようになった切欠キュウコン伝説のキュウコンが登場する。
彼の話によりいよいよ物語は終盤に差し掛かる。
(ED後)
- たいようの どうくつ
- あらしの かいいき
- ちてい いせき
- ほのおの だいち
- イナズマの だいち
- きたかぜの だいち
- はるかなる れいほう
- にしの どうくつ
- きたの さんみゃく
- ならくの たに
- ねがいの どうくつ
- やみの どうくつ
- きよらかな もり
- しあわせの とう
- ぎんの かいこう
- いんせきの どうくつ
- アンノーンの いせき
- あんや いせき
- おおきな うみ
- さいはての うみ
- さばく ちたい
- たきつぼの いけ
- ひりゅうの おか
- みなみの ほらあな
特殊なダンジョン（不思議なメールが必要）
- いへんの どうくつ
- のこされた しま
- げんそう かいきょう
- ふしぎの うみ
逃亡生活限定ダンジョン
- いわの よこあな
- ゆきの よこあな
マクノシタくんれんじょ
- ノーマルのま
- ほのおのま
- みずのま
- くさのま
- でんきのま
- こおりのま
- かくとうのま
- じめんのま
- ひこうのま
- エスパーのま
- どくのま
- むしのま
- いわのま
- ゴーストのま
- ドラゴンのま
- あくのま
- はがねのま
- チームテングス
- チームカラミツキ
- チームハイドロズ
- チームゴロゴロ
- きゅうじょたいのま
※このゲームが販売された当時は第三世代であったため、フェアリータイプは存在しない。
以後、第5シリーズ「ポケモン超不思議のダンジョン」が出るまでは他の作品でも同じことが言える。
チーム○○のダンジョンはED後に登場する。以前に出会った凄腕救助隊の4チームと戦える。
きゅうじょたいのまは青限定ダンジョン。
赤と通信することで「チームをひきとる」を選べ、実行すると赤のパーティ(最大4人)のチームがこのダンジョンに出てきます。
（赤と青のソフト、それを入れるゲーム機が必須。）
ひかりのどうくつ
本編クリア後に出現する、進化専用スポット。
レベルや道具などの条件を満たすと進化できる。
また、なつき進化をするものは代わりの方法としてかしこさと呼ばれる特殊能力(1)があり、これのパラメータ(2)を上げることで進化できるようになる。（かしこさを上げること自体に便利な特殊能力もある。なるべく楽に、そして楽しくすることができる。）
ポケダンでのかしこさとは上記２つを意味します。
（ポケモン本編とは違いポケモントレーナー、つまり人間がいないために作られた独自の文化である。）
第4世代と救助基地(ゴンベ)
救助隊最高ランクは、ルカリオランク。
これを達成するとルカリオぞうが頂ける。
マクノシタくんれんじょの全17タイプの試練を終えるとウソハチにんぎょうがもらえ、依頼のお礼にごく稀にマネネのぞう、マニューラのぞうがもらえるものもある。これらは全て救助基地の前に置かれる。
ポケモンひろばにはゴンベが出現することがある。これはかつやくのあとにも残るイベントだ。彼に食糧を渡す、もしくは彼が落としたりんごを拾ってあげるとゴンベのはらまきというアイテムがもらえるぞ。
これらのポケモンは、映画に先行登場した第4世代のメンバーがサプライズゲストとして出演した。
ゲームフリークの粋な計らいである。
