概要
メインストーリーVer.5「百花繚乱編」の第1章後半にて言及された、ゲマトリア、デカグラマトン、色彩などに並ぶ新たな謎の脅威。
その詳細は未だほぼ分かっていないが、類似した"色彩"同様、キヴォトスや生徒の持つ「神秘」を汚染し呑み込む性質を持っている模様。現に右腕が黄昏と接触した結果、御稜ナグサの右腕は動かなくなってしまった。
現在は花鳥風月部がそこに属している事のみ分かっており、彼女らは本来キヴォトスに属するものでは太刀打ち出来ない力や危険性を持って暗躍している。
PVでクズノハが乗っている鳥居にも「黄昏」の文字が書かれている他、百花繚乱の委員長とクズノハが邂逅する場所は「黄昏の寺院」と呼ばれている事からクズノハとも何らかの関わりがあるものと推察されている。