人物像
コマンダー・ヤンマーク
ゲイトによって作られたアマゾンエリアの調査員。
森林観測チームに所属しており元々はジャングルなどの森林保護プロジェクト用トンボ型レプリロイド。
ある日コントロールミスにより森林を燃やしてしまう。日ごろの成績が優秀だったため罪に問われることはなかったが、後日何者かがヤンマークの飛行システムに不正改造を施し、ヤンマークは再び事故を起こし大破してしまう。
ゲイトによって再び生を受け、ゼロについてやナイトメア、不正改造を施したとされるイレギュラーハンターやレプリロイド研究員への不信感から反旗を翻す。
様々なフォーメーションを指示したヤンマーオプションを駆使して攻撃してくる。
使用技
ヤンマーオプション
3機のトンボ型オプションを周囲に展開。多種の攻撃につないでくる。
フィルアップ
破壊されたヤンマーオプションを補充する。
フォーメーション・ウィング
「撃て！！」の声の後、オプションが上下に動き画面の端から端へ移動する。
フォーメーション・ガード
「フォーメーション、ガード！」の声と共に、オプションが弾を撃ちながら左右に移動してくる。
フォーメーション・ファイナル※ライフゲージが半分以下の時に使用
オプションを背後に従えながら、エックス、ゼロを執拗に追跡してくる。
ヘビーボンバー
フォーメーションファイナル中に、オプションが絨毯爆撃してくる。
一斉射撃 ※エックスの時のみ使用。
画面端の上方に待機し、「撃てー！」の合図と共にヤンマーオプションを使って画面上下半分に緑色の弾を発射する。 緑色の弾は破壊可能。
弾を撃ってくるオプションは、ヤンマークの周りにいるオプションの数によって変化する。
3、4機だと2機が弾を撃ってくる。6機だと3機が弾を撃ってくる。
ヤンマーオプション ※ゼロの時のみ使用。
画面端から「行けー！」の合図と共にヤンマークがゼロに向かってオプションを飛ばしてくる。
オプションが壁に当たって少し止まった後に、ヤンマークの方へ戻っていく。オプションは破壊可能。
オプションはセイバーやバスターで跳ね返すことができる。
跳ね返ったオプションをヤンマークに当てるとダメージを与える事が出来る。
但し、こちらに向かってきた時でなければ跳ね返せないので注意。
こちらに向かってくる回数は、ヤンマークの周りにいるオプションの数によって変化する。
3機だと2機が4回こちらに向かってくる。4機だと2機が5回こちらに向かってくる。
6機だと3機が6回こちらに向かってくる。
オプション追加1
体力ゲージが少なくなると、オプション1機を補充し、計4機のオプションを展開する。
オプション追加2
難易度を「むずかしい」にした場合のみ使用。（※）
体力ゲージがかなり少なくなると、オプションを更に2機補充。
計6機のオプションを展開する。
※難易度を「やさしい」にしても使用してきたという例有り。
破壊時の断末魔
「うわぁー!!」
「フォーメーション・ファイナル」の発動の瞬間時に撃破されるので、「フォーメーションウワァー!!」はコマンダー・ヤンマークの代名詞と言っても過言ではない。狙ってやると中々楽しい。
弱点武器
エックス：アローレイ
ゼロ：裂光覇
獲得武器
ヤンマーオプション（エックス）
通常：体の周囲を回転するトンボ型オプションを3匹出現させる。
出現中のオプションは特殊武器ボタンを押すことで弾を発射させられる。
武器エネルギーはオプションを新たに出現させた時に消費する。また、オプションが2匹以下になると3匹まで補充される。
オプション自体にも攻撃力があり、敵に直接当てることで攻撃することもできるが、耐久制限があるため当て続けると消えてしまう。
チャージ：一定時間、オプションが一定間隔で弾を24連射する。
弾の軌道は通常時と違い、エックスを始点に放射状に進む。
また、弾には地形を貫通する効果が加わるほか、オプションの耐久制限も無くなる。
ヤンマーオプション（ゼロ）
上+特殊攻撃ボタン。
体の周囲を回るトンボ型オプションを3体出現させる。
基本的な性能はエックスのものと同じであるが、ゼロの場合は通常攻撃ボタンでも弾を発射可能。また、オプション補充の際は再度コマンドを入力する必要がある。
ちなみにヤンマーは英語ではなく、「蜻蜓(やんま)」からきている。
