マザーブレインとはメトロイドシリーズに登場するラスボスである。
概要
惑星ゼーベスの中枢・ツーリアンにて、要塞を集中管理している機械生命体。
本来は鳥人族がよりどころとする生体コンピュータであり、老衰した鳥人族が
宇宙の繁栄を願って銀河連邦とのデータバンクを管理する目的で開発された。
サムスにとっては鳥人族の長老オールドバードや側近グレイヴォイスと共に
育ての親といえる存在であった。しかし、あまりにも高性能であったため知能、
特に人間的な感情が強くなり、自分ではなくサムスとメトロイドへ未来を
託そうとする鳥人族への不満を募らせていき、サムスへは嫉妬心を抱いて
確執が生じていく。最終的にはスペースパイレーツにゼーベスが侵略された際に
鳥人族を見捨て、宇宙海賊に協力することが銀河に真の繁栄を導くと判断し、
宇宙海賊を統率するコンピュータと化してしまった。
本来の用途故に、極めて高度な演算能力や論理性・分析力を持ち、宇宙海賊への
協力の際にはそれが遺憾なく発揮されて、銀河連邦を脅かす程の組織巨大化の
要因となってしまった。
本来は戦闘兵器でなく、自分からは動けず攻撃もあまりできないが、
ミサイルでしか壊せないゼーベタイトを分子転送させたシールドで強固に
守られており、周囲に設置されているビーム砲を操って侵入者を迎撃する。
一度はサムスによって破壊されたが、ゼーベス再建の際に修復されて蘇り、
再びサムスと対峙する。第一形態は前作と同じ戦法だが、第二形態は巨大な
胴体と手足をつけて復活する。
さらにサムスの装備ですらダメージをあまり与えられない程の防御力と、
回避不可能かつ一気に数百ものエネルギーを削るハイパービームを放つなど、
大幅に強化された能力でサムスを圧倒するが、ベビーメトロイドにエネルギーを
吸い取られ庇ったベビーメトロイドを殺すも、ベビーメトロイドから最後の力を
もらったサムスのハイパービームによって完全に破壊された。