初期メンバー
黒字は車両。
のぞみずほ
初登場は「バトレールproject special～1周年！映画祭！バトレールを救え！～」。
初勝利は「バトレールproject pii wataさん、km2693133さん、simakaze 50000keiさんと交流戦 part2」の2戦目。モデルはN700系みずほで、左半分はのぞみ号カラーになっている。
色合いが明るいのは悪の車両のメンバー中で数少ない特徴。基本的にどんな競技であっても最序盤に出場するため勝率は高くない。
黒ビスタカー
初登場は「バトレールproject special～1周年！映画祭！バトレールを救え！～」。
初勝利は「バトレールproject pii wataさん、km2693133さん、simakaze 50000keiさんと交流戦 part2」の4戦目。モデルは近鉄ビスタカー。
卑怯な性格で、デビュー早々に自分たちが定めたルールを勝手に破るなど勝つためには手段を選ばない。また身代わりを使ったりポイントを固定するなどバトルそのものにおける駆け引きも上手な策略家。
パープルキハ40
初登場は「バトレールproject special～1周年！映画祭！バトレールを救え！～」。
初勝利は「バトレールproject pii wataさん、km2693133さん、simakaze 50000keiさんと交流戦 part1」の4戦目。モデルはキハ40系鬼太郎列車。
敵キャラとしてデビューする前は会長職を持っていたが、デビュー後は悪の車両を取り仕切るリーダー的役割になっておりほとんどの競技でラスボスとして登場する（ただし、後述する山手線が主役のエピソードで一度だけ中ボスに格下げになったことがある）。2020年8月現在、推薦者バトルで山手線が敗れたことにより、勝率は組織中でトップである。またこの推薦者バトルでは決勝に進出し総合2位を記録した。
古明地紫緒里(現在は改心)
コレミス(現在は改心)
追加メンバー
黒字は車両。
E231系500番台山手線
初出場は「バトレールproject 特別編 〜悪の組織との2日間〜 part2」。
初勝利は「バトレールproject 悪の車両の機密バトル」の2戦目。改造はなし。
E235系山手線を恨んでいるらしく、デビューしてから執拗に付け狙っている。「バトレールproject E231系山手線の襲撃」シリーズはE231系山手線が主役のエピソードであり、シリーズ後半ではラスボスとして登場。主人公級ポジションの車両を5両抜きして引き分けに持ち込んだ。
黒200系
初出場は「バトレールproject 特別編 〜悪の組織との2日間〜 最終回」。
初勝利は「バトレールproject E231系山手線の襲撃 part2」。モデルは銀200系。
デビュー時点で1年半ほど前から組織に加担しており、初期は黒100系と名乗って味方のように振舞っていた。ところがそれを見破られたことによって本性を表し、組織に本格的に加入。また、サバイバル系競技で一般車両に勝利した最初の車両である（バトレールproject 迫り来る組織の影 part4でパープルキハ40も達成）。
E3系つばさ2000番代(新塗装)
初出場は「バトレールproject 怪しき車両 part3」。
初勝利は「バトレールフレンズ 第18回」の7戦目。改造はなし。
E231系山手線に協力してE235系を狙っている。また、ジャパリパークのことをメンバー中で一番知っているようであり、ブラックジャガーの愛車として組織の中で唯一スピンオフ作品のバトレールフレンズにも登場している。同19回では、平面交差でフルル、ジェーン、プリンスを撃破する活躍を見せた。
黒阪急
初出場は「バトレールproject special 秘封倶楽部絶体絶命」。
初勝利は「バトレールproject Summer Vacation推薦者バトル 予選1 後編」の16戦目。モデルは阪急9000系。
組織のメンバーでは一番新しく、公式ホームページにも一切その情報は記載されていない。また、上記の初勝利を決定づける時に撃破したのは黒ビスタカーだが、彼より立場が下であることが言及されている（ただし、初登場回で黒ビスタカーと会話した時は普通の口調で話していた）。
漆黒の隼
初出場は「バトレールproject 怪しき車両 part3」。
初勝利は不明（上記の推薦者バトル回で勝利したが、それ以前に初勝利した可能性がある）。モデルはE5系はやぶさ。
上記の初出場回でEつばさ2000とともにデビューしたがpart4ではなぜか組織の車両の中に入っていなかった。その他の情報求む。
黒つばさ
初出場、初勝利ともに不明。モデルはE3系つばさ。
推薦者バトル回までには悪の組織に加わっていたことが確認されているが、ほとんどが謎に包まれている車両である。こちらも情報求む。
ブラックジャガー
ハシブトガラス
サマリ
インプラー(コウテイペンギン)
ファルコン
ヤタガラス
潜入調査メンバー
黒字は車両。
レールスター
初出場は「バトレールproject 特別編 〜悪の組織との2日間〜 part2」。
初勝利は「バトレールproject 怪しき車両 part4」の2戦目。改造はなし。
205系や0系と示し合わせて組織に潜入。情報を探るスパイとして活動しており、このことは組織にはばれていない。E231系山手線のことを警戒しており、「彼奴はマジ（の危険車両）だ」「立派な悪人」などと評している。
スカイライナー
初出場は「バトレールproject 特別編 〜悪の組織との2日間〜 part3」。
初勝利は確認できず。改造はなし。
レールスターとともに諜報活動をしているが他の2両と比べてどこか影が薄く、2020年8月現在ではこれといった活躍をする回や主役回は存在しない。
683系
初出場は「バトレールproject 怪しき車両 part3」。
初勝利は確認できず。改造はなし。
3番目に判明した調査メンバー。Eつばさ2000を専門に監視しており、デビューと同時にEつばさ2000がE235系を狙った時にはそれを見抜いた。
霍青娥
