第1期
NET（現：テレビ朝日）系にて1966年4月7日から9月28日まで放映。全26話。モノクロ作品。
原作同様に現代が舞台だが、時代劇を得意とする東映京都の制作のため、時代劇のイメージが強い。
ハットリくんは「顔のマスク」を被った双子の子役俳優が交互に演じているが、目がギョロっとなったり光ったりするシーンがあるため、モノクロ画面と相まって非常に怖いことでも有名。 フィルムは長らく第1話「ハットリくん来たる」以外のポジフィルムは所在不明であったが、2010年に第14話「お食事騒動」の保存が確認され、同年10月に東映チャンネルで放映された。
第2期「忍者ハットリくん+忍者怪獣ジッポウ」
1967年8月3日から1968年1月25日まで放映。全26話。モノクロ作品。
当時の怪獣ブームの影響受け、忍者怪獣ジッポウが初登場し、後に原作漫画やアニメにも逆輸入された。
制作は東映京都から東映東京に替わったため、前作よりも現代的な作風となっている。
当時中学生であった松坂慶子が出演していたことでも知られる[19]。
東映に全話のフィルムが保存されており、後に東映ビデオから全26話分のDVDが発売された。
