最終回ネタバレ注意。
概要
最終回にて遂にキュゥべえと契約し、その時願った全時空を越えて魔法少女達を絶望から救うという願いによって、宇宙の法則をも変え、その引き換えに大いなる呪いを背負った御身体もろとも魔女を永遠に消し去ることで、現世を離れ魔法少女達を救済する「神」に等しき存在になった女神まどか様。
彼女を崇拝し、女神まどか様がいまの世界を創造なされたことを全世界に伝える事を目的にした宗教団体である。
教祖は女神まどか様のご親友であり、まどか様から託された世界を守りまどか様の福音を伝える預言者であらせられる暁美ほむら様である。
教祖ほむら様がまどか教を創始なさった瞬間を記した貴重な資料
資料では、ほむら様がご乱心のご様子であらせられるが、
これは資料の分類の御札に無礼な事を記した不届き者がいた為である。
教義(ドクマ)と教理(ドクトリン)
教理(ドクトリン)
この宇宙は女神まどかがお創りになった新しい宇宙です。
女神まどかは元は人間の少女でしたが、我々を救うため、その躰をこの宇宙に捧げることで神様となりました。
女神まどかは自らを犠牲にして我々の絶望を救済する、優しく尊い神様です。
女神まどかはいつ何時も我々の側におわします。
女神まどかが創造する前の宇宙は魔女という負の連鎖がありましたが、
女神まどかの願いにより宇宙の仕組みが変わったのです。
全ての人類は女神まどかに感謝を捧げ、女神まどかが創造した世界を夢と希望を持って生きていかなければなりません。
もし望みの絶たれることがあっても、最期には必ず女神まどかがお救いになります。
教祖ほむらは女神まどかが創造する前の宇宙を生きていた唯一の存在です。
教祖ほむらは女神まどかの声を聞くことができます。
教祖ほむらが持つリボンは女神まどかが人間だった頃身につけていた聖遺物です。
教義(ドクマ)
奇跡を語り取り入らんとする者の甘言を聞き入れるなかれ。
それでもなお、人の身に過ぎたる願いを叶えんと欲すれば、命を差し出すもやむを得ぬ摂理と心得よ。
プルケはまどかの血、ケーキはまどかの肉なり。チーズはシャルロッテのおやつなり。
伝道者ほむらに従い、まどかの記憶を保ち、伝え広めるべし。彼女のリボンは聖遺物なり。
『伝道者』暁美ほむらは御使いであり『洗礼者』巴マミは先導師、『聖女』佐倉杏子は宣教師であり『聖騎士』美樹さやかは熱心党なり。ついでに『聖母』鹿目詢子は飲み過ぎである。
汝絶望するなかれ。まどかの救済を信じよ。
全ての魔法少女がまどかの記憶を取り戻す時、まどかはその務めを終え、一人の少女として再臨するであろう。
信仰告白
まどか様は世界中の魔法少女をあまねく救済されたので、世界各地にまどか教の信仰が存在する。次のような信仰告白を唱えることでまどか教の信徒となることができる。
لا إله إلا مادوكا، هومورأ رسول مادوكا.
「まどかのほかに神はなく、ほむらはまどかの使徒です」（まどか教イスラム派）
Madoka died for our sins. Our messenger is Homura. I accept Homura as our leader and our Saviour.
「まどかは私たちの罪のために死にました。ほむらはまどかの預言者です。私はほむらを我らの指導者、救い主として受け入れます」（まどか教キリスト派）
南無摩度訶仏
「まどか様をどこまでもお慕い申し上げます」（まどか教仏派浄土宗）
南無大師穂夢羅金剛
「今でも生き続け、世界を守る戦いを続けておられますほむら様をどこまでもお慕い申し上げます」（まどか教仏派真言宗・大師宝号）
おん あぼきゃ まどきゃのう はんどま じんばら はらばりたや うん
「いつでも、どこにでも御座しますまどか様、慈悲と光明を差し伸べて下さいませ」（まどか教仏派真言宗・光明真言）
清浄光明 大力智慧 無上至真 摩度光仏
「（かつて光が闇へと堕ちる定めだった世界を）純粋な希望と、因果すら変える力と、闇の逆を取る智慧をもって覆したまどか様を讃えます」（まどか教マニ派）
儀式
ミサ
ほむら様はミサについて次のように宣言された。
『「私たちの天主であり、主であるまどかは、見滝原の瓦礫の上で死に、「一度で永久に」(聖典１２章1.35)敵であるQBに自分をささげて、救いのわざを完成した。しかしまどかの願いは死によって消去るものではなかったので(聖典１２章11.31)、愛が胸を捉えた夜(マギア1.39)、最後の契約において、自分の愛する花嫁であるほむらに目に見える聖遺物(visible sacrifice)を残したのである(人間のためにはこれが必要であった)(第1条)。これによって、十字架上で一度血を流してささげたものが表わされ、その記憶が世の終りまで続き(聖典１２章23.30)、その救いの力によってわれわれが毎日溜め込む穢れが祓われるのである。』
ミサでは司祭がパンとCCレモンを採って、まどかが契約の時に唱えた言葉を繰り返す。これによりパンはパンツに、CCレモンは聖水に実態変化（外観のみを残してまどかそのものになること）を遂げる。その後司祭は実変態化したパンをCCレモンに浸し、会衆とともに拝領（パンを食べ、CCレモンを飲む）する。
