第1次シャーロット・ホーネッツがルイジアナ州ニューオーリンズへ移転した後の2003年に、ノースカロライナ州シャーロットを本拠地として新たに作られたチームである。
現在のホーネッツの球団史では、2002-03と2003-04の2シーズンは活動を休止して、2004-05シーズンからボブキャッツとして活動を再開したとしている。
2004年の時点でホーネッツの名前はニューオーリンズのチームが使用を続けていたために、新たなチーム名としてボブキャッツ（ヤマネコ）を採用した。チーム名はカロライナの固有種である獰猛な肉食獣から採ったとされているが、創設者のロバート・ルイス・ジョンソンのニックネーム“ボブ”と、シャーロットに本拠地を置いているNFLのチーム“カロライナ・パンサーズ”（黒豹）と同じネコ科の動物の2つの意味を持たせたものとも言われている。
ボブキャッツ初年度の2004-05シーズンはアトランタ・ホークスの低迷もあってサウスイーストディヴィジョンおよびイースタンカンファレンスの最下位は免れたものの18勝64敗で終わった。なお、この年はボブキャッツ時代では唯一となる個人タイトルの獲得（エメカ・オカフォーが新人王）があった。
ボブキャッツはカンファレンス内で10位以下に沈むシーズンが殆どで、特に2011-12シーズンはロックアウトでレギュラーシーズンが16試合少ない66試合だったこともあったが僅か7勝しか挙げられず、リーグで唯一1桁しか勝てなかった。
2009-10と2013-14の2シーズンは第7シードでプレイオフ進出しているが、どちらの年もプレイオフでは勝ち星を挙げることが出来ず1回戦で敗退した。
ニューオーリンズ・ホーネッツが2013-14シーズンからチーム名をニューオーリンズ・ペリカンズに変更すると、ボブキャッツは『ホーネッツ』の名前をニューオーリンズから取り返し、2014-15シーズンからシャーロット・ホーネッツとなった。改名と共に、第1次ホーネッツがシャーロットを本拠地にしていた1988年から2002年までの歴史と戦績も受け継ぐことになった。
