1991年4月に開局したが、実は1990年10月に開局するはずだった。この開局の遅れ故に、1990年10月から1991年3月までは、福岡放送が長崎支局を設け、長崎県内の取材を行っていた。ちなみに1990年9月までは、フジテレビ系列局のはずのテレビ長崎が、日本テレビ向けにもニュースの送配信を行っていた。そのせいか、本局の株主にフジテレビ（フジメディアホールディングス）が名を連ねている。ちなみに、テレビ長崎は、日本テレビとの縁が切れた今でも、日本テレビの親会社である読売新聞が筆頭株主になっている。もっとも、元々は佐賀県の割り当てられていたUHF電波を急遽長崎県に割り当ててもらった上での設立･開局ではあった。
歴史上有名な出島の跡地に本社を構えるが、スタジオが狭すぎるからか、今や地方テレビ局では当たり前となっている平日夕方のローカルバラエティ番組を制作･放送していない。また、本社ビルには、読売新聞の長崎支局も置かれている。
「デジタル所さん」、「NANA」、「HUNTER×HUNTER」のほかにも、日本テレビ制作の深夜アニメをかなり放送しており（例:「エアマスター」、テレビアニメ版「ごくせん」）、最近では「ばらかもん」を放送している。ただ放送日時は金曜34時－34時30分･･････。もう少しマシな時間に放送出来なかったのか?「ハヤテのごとく!」第1期やどこぞのTBS系列局における「たまごっち」じゃないんだから･････････。また、何を血迷ったか、2002年1月から3月にかけて、WOWOWアニメ「あぃまぃみぃ!ストロベリー・エッグ」の放送をやらかしたことがある。
