概要
『マリオ&ルイージRPGシリーズ』の2作目。
今作はマリオとルイージに加え、ベビィマリオとベビィルイージ（赤ちゃん時代のマリオとルイージ）も操作できるようになった。
ゲーム中の音楽は『スーパーマリオRPG』、『マリオ&ルイージRPG』に引き続いて下村陽子が担当している。
プロローグ
ある日、キノコ王国で、
天才発明家オヤ・マー博士が、
タイムマシンを発明しました。
その原動力は『コバルトスター』!!
よろこんだピーチ姫は、
早速過去のキノコ王国へと旅立ち、
それを見たキノじいは心配のあまり
倒れこんでしまいました。
そこへ現れたのが、ボロボロになった
タイムマシンとナゾの宇宙人。
しかもピーチ姫の姿はどこにもありません。
博士によると、姫はまだ過去の世界にいるようです。
城の中には、過去へつながっているという
タイムホールも発見されました。
そこで、マリオとルイージの出番です!
タイムホールへ飛び込んで、新たな冒険の始まり始まり!!
過去の世界で出会う子どもの頃の自分たち―――――
べビィマリオやべビィルイージと共に力を合わせて
さぁ、ピーチ姫を救い出しましょう!
（マリオ&ルイージRPG2取扱説明書より）
ちなみに
パッケージのタイトルロゴには『マリオ&ルイージRPG2×2』と記されているが、これはデザイン上のものであり、正式なタイトルは『マリオ&ルイージRPG2』である。
