ぷよぷよフィーバーの続編で２００５年１１月２４日にＰＳＰ・ＰＳ２にて発売された。
※ＤＳ版は１２月２４日に発売。
なお、２の部分は「ツー」や「に」ではなく「チュー」と読む。
略称は「ぷよチュー」、「ぷよチュ」。
あらすじ
いつの時代・・・ どこの世界・・・
すてきな魔導師（まどうし）になることを夢見て
勉強するアミティ
新学期が始まり クラス替え
同じクラスになったのは クルークだけ・・・
はじめて同じクラスになったのが シグ
いつもぼーっとしている とってもふしぎなおとこの子
シグには へんなタマシイがくっついてる・・・？
なんだか新しいことが まちじゅうにまちうけている予感・・・
（取扱い説明書より抜粋）
登場キャラクター
説明書の一番最初の一言のみです。
※一部キャラクターのみＨＰ紹介より抜粋。
キャラクターに関する詳しい説明は各キャラクタータグにてご確認ください。
フィーバーから登場していたキャラクター
本編１人目の主人公で魔導学校に通う元気な女の子
アミティの元クラスメートで２人目の主人公
前作と同様にアミティのクラスメート
アミティの元クラスケートで、人間と少しだけ違う種族の少女
アミティの友達で、クラス替えで離れた元クラスメート
ユウちゃんは異常に明るい幽霊の女の子
レイくんは異常に明るい幽霊ユウちゃんの、以上に暗いふたごの弟。
前回に引き続きアミティのクラスの担任
ひとをバカにしたような態度で常にファッションチェックをかかさない。
アミティたちの学校の近くにいるトリ。
ぷよを消しているうちに、遠い世界からアミティたちのいる世界へ飛ばされてきた女の子
海の世界の王子様（あくまで自称）
アミティたちの学校の近くによくいるカエル
アミティたちの学校裏の森にいる子オニ
おやフランケンは孤独な人造人間
こフランケンはちいさな人造人間