整備新幹線に含まれるのは以下の5路線である。
このうち北陸新幹線の高崎長野間の117kmは長野新幹線として、東北新幹線の盛岡新青森間179km、九州新幹線の博多鹿児島中央間257kmは開業済みで北陸新幹線長野金沢間は2014年度に、北海道新幹線新青森新函館北斗間は2015年度に開業予定。
なお東海道新幹線、山陽新幹線、東北新幹線東京盛岡間、上越新幹線、成田新幹線(未成)は整備新幹線ではない。また中央新幹線も整備新幹線ではない。
整備新幹線の建設に必要な財源は税金で賄われる。開業後に設備がJRへ引き渡され、収益が発生するとその路線の収益に合わせた貸付料をJRが支払うことで建設費を回収する。