概要
ユーラシアカワウソの亜種説と独立種説が存在する。
北海道に生息していた個体群は「エゾカワウソ(Lutra lutra whiteleyi)」と分類される場合もある。
北海道から九州に至る日本各地に生息が確認されていたが、良質な毛皮を求めて大正から昭和初期にかけて乱獲が進み、生息数が激減。1928年に狩猟が禁止された。だが第二次世界大戦後の農薬の普及による水質悪化と河川護岸の進展によりその後も数を減らして生息地域は四国の一部だけになり、1965年に特別天然記念物に指定された。
しかし、わずかに生き残ったカワウソも漁具を荒らすのが嫌われたため漁師がハンターに依頼して密かに駆除され続けており、絶滅危惧種に最後のとどめを刺してしまった(最後まで生き残っていた個体群も、密猟されていたのが外部に知られたものである)。1979年以来目撃例がなく、特別天然記念物に指定されたもののそれ以来確実な生存記録がなく2012年絶滅種に指定された。
生存説
1996年にカワウソの可能性がある足跡が高知県で見つかったほか、愛媛県や北海道や栃木県ではたびたび目撃情報があるが、確実な証拠はない。
2017年8月、琉球大学がツシマヤマネコの生態調査にために設置した定点カメラにカワウソが写っていることが発表された。日本国内で、野生のカワウソ見つかったには38年ぶりであった。然し糞を調べた結果、大陸産のユーラシアカワウソで、韓国南部から漂着物に乗って渡ってきたとされた。
なお
実は、ニホンカワウソの種としての登録は急いていたという説もあり、
- ニホンカワウソがユーラシアカワウソとどう違うのか?
- 日本列島にはユーラシアカワウソもいた可能性は?
などの疑問が解決されないまま種登録されたのでは、という意見もある。
実際、神奈川県産の剥製を遺伝子解析した結果、ユーラシアカワウソと同一とされた。然し、高知県産の剥製も調べた結果、遺伝子的に別系統であり、別種もしくは別亜種の可能性があるとされた。