ストーリー
ある日ルパンは裏社会の顔役「藤堂昌江(CV野沢雅子)」に「闇オークションに行き、『人魚の鱗』と言う宝石を盗んでこなければこの女（不二子）を殺す」と脅迫され、ルパンは次元、五ェ門と共にオークションへ潜入。「人魚の鱗」の持ち主は「氷室」と言う男。ルパン達は銭形の警備を潜り抜け、盗むことに成功・・・、と思いきや、盗んだのは本物そっくりのニセモノだった。同時刻、依頼主の藤堂は何者かに殺された。後日ルパンは藤堂を殺したのは氷室で本物は彼が持っていると推理。藤堂の事務所から脱出した不二子は人魚の鱗と「龍鱗石」を手に入れると、「八百比丘尼の財宝」が手に入ると言う。
ルパンは「龍鱗石」を盗み出したが、「麻紀」と言う少女に出会い、成り行きで弟子入りにした。
2人は氷室の会社に潜入し、本物の人魚の鱗を手に入れた。
次元と五ェ門は、氷室の屋敷し進入、すると1人の女性に出会う。次元は藤堂の秘書「美沙」だった事を思い出した。2人は彼女は不老不死の力を持っているそ知り、「氷室は危険な人」と警告され、氷室が雇った「影浦」から退散した。ルパンは麻紀と美沙との関係と過去、そして宝を手に入れるには第3の鍵「不死身の体を持つ人間」が必要と知り、麻紀に「必ず彼女を盗む（助ける）」と約束する。
不二子は氷室の研究所に潜入し、美沙を救い出すが、目を離した隙に麻紀は氷室に連れ去られた。
ルパン達は宝があると言う島に向かう。その頃銭形はルパンを捕まえるために氷室の事を調べていると、部下から「当時の持ち主から『人魚の鱗』と『龍鱗石』を盗み出した者がルパン一世と記されていた」と聞かされた。
ルパンは次元に秘密を語る。かつて祖父は手にしながら持ち帰らなかったただ一つのお宝があると。その名は「八百比丘尼の財宝」。
ルパンとは一体何なのか？八百比丘尼の財宝の正体とは・・・？答えは死の門を潜り、2つの宝石を扉に使い扉を開けたとき、全ての答えが判明する・・・。
登場人物
ルパン･次元･五ェ門･不二子･銭形･氷室はタグが存在するので省略
麻紀
cv渋谷はるか
幼少期に父の蒸発で行き場を無くし養護施設に預けられた14歳の少女。折りたたみの自転車を愛用。
誘拐同然に美沙を連れて行った藤堂を追った。藤堂がいるオークション会場の近くで彼女の動きを探りながらポップコーンを売っているとニセモノの人魚の鱗を盗んだルパンと遭遇する。彼と一緒にいれば美沙と会えると思い、ルパンに弟子入りをした。ルパンを「先生」と呼んでいる。
美沙を助けてくれた後、「彼女を盗む」と約束したルパンに感謝している。
美沙
cv清水理沙
かつて麻紀と同じ養護施設にいた女性。幼い頃、両親が事故で亡くなった際に生き残ったことを悔やんでいる。八百比丘尼の不死の呪い（どんなに致命傷なケガをしてもすぐに傷が治る）で皆は離れていったが麻紀は相手にしてくれた。
麻紀の事を実の妹のように思っていた。施設の負債を肩代わりする形で藤堂の秘書を務めていたが、体質のことを知った氷室に拉致される。不二子に救出されるが、今度は氷室は麻紀を誘拐し、やむ得なく財宝の封印を解くことに。終盤、母方父方のどちらかから自分が八百比丘尼の血統を受け継いでいる事実を告げられ特異体質の根源を知る事となり、その時には驚きを隠せずにいたが後に八百比丘尼の魂に乗り移られ、氷室に追い詰められたルパンたちを助けることとなる。八百比丘尼が成仏したためなのか、最後には不死身の体質が消えた。（その事を彼女は「呪いを盗んでいった、泥棒さんに・・・。」と言った。）
影浦
cv斎藤志郎
氷室が雇った殺し屋で藤堂を殺した奴でもある。特殊な日本刀を使う。終盤で五ェ門との一騎打ちで破れた。
八百比丘尼
cv清水理沙
八百年生きたとされる伝説の女性。本作中では「やおびくに」と呼ばれるシーンが多い。陥る絶望からやがて仏門に帰依し姿を消した。その際所持していた「数多い公家からの貢物」を何処かに隠したとして伝説が残り、それはやがて「八百比丘尼の財宝」と呼ばれる事となる。伝説の真実は、自らの悲劇を二度と起こらない様、子孫（今まで婚姻した公家との間に出来た子供の孫など）へ己の精神を封じた肉体を永遠に隠し続ける（この時、肉体の一族・鍵の一族・古文書の一族が発生）。その隠された肉体こそが「八百比丘尼の財宝」だった。やがて幾年も過ぎ、最後に出会った男性（ルパン一世）の約束を楽しみにしながら眠り続けていた。後に自身の肉体を氷室に吸い尽くされるも、魂だけが美沙の体を借りてルパン三世を助け、子孫である彼（正確にはルパン三世がルパン一世と勘違いしていた）に感謝の意を述べ、成仏した。そのためか、美沙の特異体質が消えた。
