概要
その名の通り、デュエリストを養成する施設である。
残念ながらZEXALには登場しない。
ARC-Vでは、同名の施設が登場するが、設立目的が根本から異なるものと言える。
『GX』でのデュエルアカデミア
オーナーは海馬瀬人（遊戯王Rにおいてアカデミア創設の伏線とも言える発言をしている）。
孤島に建てられているため、完全寮制である。
生徒のレベルによって階級が分けられており、
オシリスレッド、ラーイエロー、オベリスクブルーの順で階級が上がっていく。
階級間での待遇は激しく（本来は競争によって実力を磨かせる事が目的だったのだろうが）、オシリスレッドの生徒は狭いアパート暮らしであり上級の生徒からは見下されている（ストーリーの進行により段々と改善するが）。
また、ティラノ剣山の入学時のクロノスとナポレオンからの言葉によると付属校で、中途入学の成績優秀者はオベリスクブルーではなくラーイエローからの入学となる模様。他に個人的な要望で下の階級への異動や残留は可能であり、レッドにい続けた十代や実力不足を痛感してブルー寮を拒んだ丸藤翔の例がある。
基本的に女子はオベリスクブルー配属になるが、早乙女レイの様な例外もいる。
舞台となる校舎以外にも姉妹校が存在し、それぞれで制服も異なる。
ちなみにデュエルが中心の学校ではあるが、高等学校に相当するのか国語や数学、物理に保健体育などの一般教科の授業も存在する。何故だか「錬金術」なる妙な科目が存在しているのだが……？
単位を取らないとしっかり補習（補習授業はデュエルを絡めて行われたが）もあり、初期ではデュエルの学校なのにスポーツの授業がある事を運動が苦手な丸藤翔が嘆いていた。
他にはテニス部やオカ研などの部活・同好会も存在している。
制服
男子
オシリスレッド、ラーイエローではそれぞれのシンボルカラーで塗られたジャケットと、ズボンを着用する。
オベリスクブルーの制服はジャケットの後ろが長く、ズボンが黒い。また胸のラインのデザインが違う。
女子
上はノースリーブ、下はミニスカートであり、足はかかとのあるブーツを履いている。
デュエル時は指の穴のあいたグローブも着用。グローブの裏側には青いふちの付いた白い手袋の様なものが付いている。
とても制服とは思えない露出度の高い恰好であり、明日香のメリハリの付いたボディをより強調するのに一役買ってたりする。
設定上、オシリスレッドとラーイエローの制服は見る機会が少ない。
遊戯王オンラインでのアバターでは、両者の制服がアバターアイテムとして存在した。
基本的にデザインはオベリスクブルーの物と変わらないが、オシリスレッドの制服はカラーパターンが違う。
（スカートが白でジャケットが赤）
尚、早乙女レイのオシリスレッド制服はデザインがオリジナルのものとなっている。
ただ、タッグフォース３でオベリスクブルーとして登場する時は明日香と同じデザインの制服を着る。
姉妹校
姉妹校の生徒はそれぞれ違った服を着て登場するが、
私服のような恰好もあるため制服なのかどうかは謎。
漫画版GXのみに登場するアメリカ校の制服は、灰色を基調としており帽子があるのが特徴的である。
胸に勲章の様なものもあしらわれているが、優秀な生徒だけに付けられるのか全生徒に付いてるのかは不明。
『5D's』でのデュエルアカデミア
GXとは違い普通にネオ童実野シティにある。
小等部、中等部、高等部が存在する。
GXの様な階級は無いが、作中では成績の悪いクラスの生徒が退学にさせられそうになっており、相変わらず落ちこぼれへの風当たりは強いようである。
また、かつてクロノス教諭が使用した「古代の機械」シリーズが「アカデミア伝統のカード群」として伝わっているが、残念な事にクロノス先生の理念の方は伝わっていない様だ。
漫画版では女子校のデュエル・アカデミア・クイーンズ、サイコデュエリスト用のデュエル・アカデミア・サンクチュアリの２校が登場している。
制服
男子は青のブレザーにネクタイとズボン、女子は赤のブレザーにリボン、ひだの付いたミニスカートを履く。
前作に比べると割と一般的な制服のイメージに近づいたと思われる。
なお十六夜アキの制服は復学前後で異なり、復学後は一般生徒と恰好が少し違う。
（後ろが長く胸のリボンが無い）
一応劇中でアキは優等生扱いであることを考慮すると、意外と改造制服には寛容なのかもしれない。
また、女子の靴下は黒字に白のライン入りソックスが主に用いられる。
が、アキや龍可はいつもの格好の様なソックスを履いており、タッグフォースでもニーソックスや色違いのソックスを履いている生徒が登場する。
現に厳格な委員長キャラとして知られる原麗華が黒のニーソックスを着用しているため、ソックスに関しても寛容なようだ。
『ARC-V』でのデュエルアカデミア
主人公・榊遊矢達の暮らす「スタンダード」と呼ばれる世界とは異なる異世界「融合次元」に存在する施設。
スタンダード出身で、大企業「レオ・コーポレーション」の初代社長である赤馬零王が、設立や運用方針に少なからず関わっている。
デュエルモンスターズを戦闘に応用して戦う「デュエル戦士」の養成を目的としており、優秀な成績を収めた者達は、デュエル戦士として別次元に送還され、武力的侵攻を行っている。
紫雲院素良もこの施設出身のデュエル戦士であり、特進クラスで優秀な成績を収めた実力を見込まれ、特別任務を与えられてスタンダードに送り込まれている。
命懸けで戦う戦士達を育成する為か、負傷したデュエル戦士達を治療する為の医療設備も整っている。
また、アカデミアの中でも特に実力のあるデュエル戦士は、独自のデッキを所有しているが、それ以外のデュエル戦士達は、カード効果によって連携しやすいようにする為か、全員「古代の機械」モンスターのデッキを使用している。逆に言えば、実力のあるものでなければ、独自のデッキでデュエルする事は許されない模様。
エクシーズ次元の住民達は、アカデミアのデュエル戦士達による武力侵攻を受けており、次々とカードの中へと封印されてしまっている。
その際、またも「古代の機械」モンスターの軍勢が確認されている。
『GX』等に登場したデュエルアカデミアと似ている部分もあるが、『武力侵攻を行う為のデュエル戦士の育成』を目的としている事からも、運営方針は根本から異なっている。
制服
GXの制服同様に三種類のカラーリングがあるものの、階級の存在は現時点では不明。
男子と女子の制服に大きな違いは無い。
オベリスク・フォース
デュエルアカデミアの精鋭部隊は「オベリスク・フォース」という名称を持ち、青い制服にオベリスクの巨神兵を意識した仮面姿で統一されている。
詳細はオベリスク・フォースを参照。
もっとも、作中ではぶっちゃけモブ扱いである。主に「古代の機械（アンティーク・ギア）」シリーズのモンスターを使い、エクシーズ次元だけでなくスタンダード次元のデュエリスト達をも苦しめた。
本作のデュエルアカデミアは「軍隊」としての側面を持っているだけあって、本格的な軍事･戦闘訓練は受けており、シンクロ次元への侵攻時はグライダーで空を飛び回ったり、ビルの間を飛び回ったりと、高い身体能力を発揮している。
その性格は「３対１でリンチのようなデュエルも平気で行う」「デュエルで負けた者はもれなくカード化」「無駄にエリート意識が高い」等、悪者側のヤラレ役にありがちなものだった。結果的には、主に黒咲隼にコテンパンにされていた。
