－－－これは、光の中に完結する物語－－－

内気な高校生の武藤遊戯は、千年パズルを解いたことにより闇の人格を手に入れ、闇のゲームの番人（闇遊戯）となる。
危険で過激なゲームで敵と勝負し、倒した敵に罰ゲームを与え成敗する、というのが当初のストーリー。

色々なゲームが登場し、実在のアナログゲームを元にした物も多く、そうしたゲームの数々を紹介するという側面もあったと言えるだろう。中にはカプセルからガチャしたモンスターを戦わせるスマホゲームの原点、現代からTRPGの世界に魂を封じられるこのジャンルの原点（TRPG側ではなく、現実側がメインの構成）があった。

ゲームという題材は当時様々な少年誌で模索されていた殴らないバトル漫画というコンセプトで考案された（もっと前の作品だとこれとか。最初は様々なゲームで戦っていて、途中で戦い方が一種類になった作品繋がりならこれとか）。

特徴

「もう一人の自分」「見えるんだけど見えないもの」という重要単語が連発されており、後者は第一話のオチの他、情感やフェロモンにも例えられる。
主人公と親友の友情、主人公ともう一人の自分（もう一人の主人公）の葛藤、男の子と一緒にゲームに嵌り込む（男の子の恋愛相手に留まらない）女の子も描写されており、リアルファイトはメインのゲームパート以外で描写されがちであった。

カードゲーム化

本作を語るうえでカードゲーム路線は外せない。

様々なゲームが繰り広げられる中で、架空の対戦型カードゲーム「マジック&ウィザーズ」が人気になり、中盤以降は「マジック&ウィザーズ」（M&W）が中心のストーリーとなった。
この「M&W」は、「Magic: The Gathering」を元ネタにしているため、当初はMTGの抽選プレゼントもあったのだが、次第にパロディだったはずのM&W自体の人気に火がつき、後に「遊☆戯☆王オフィシャルカードゲームデュエルモンスターズ」（遊戯王OCG）の名前で商品化され、大ブームを巻き起こした。

放送中のアニメ作品に合わせて「遊☆戯☆王ファイブディーズオフィシャルカードゲーム」「遊☆戯☆王ゼアルオフィシャルカードゲーム」「遊☆戯☆王アークファイブ　オフィシャルカードゲーム」と変わっていったが、現在は「遊戯王オフィシャルカードゲームデュエルモンスターズ」に戻っている。

また「遊☆戯☆王デュエルモンスターズ」（遊戯王DM）は動画サイトニコニコ動画など、ネット上での知名度・人気が高く、特にニコニコ動画の開設初期の人気が高かった。