下位分類
Gekko コバンヤモリ属
Ptychozoon トビヤモリ属 - 8種 クールトビヤモリ
Pseudogekko - 4種
Lepidodactylus オガサワラヤモリ属 - 32種
Luperosaurus - 13種
Nactus - 12種 ペラジックヤモリ
Dixonius - 5種 シャムザラハダヤモリ
Heteronotia - 5種
Hemiphyllodactylus キノボリヤモリ属 - 15種
Gehyra フトオヤモリ属 - 43種
Rhinogecko - 2種
Alsophylax - 6種
Microgecko - 4種
Cyrtodactylus ホソユビヤモリ属 - 約200種
Hemidactylus ナキヤモリ属 - 約130種 ヒラオヤモリ・マツカサヤモリ
Altiphylax - 6種
Mediodactylus - 13種
Pseudoceramodactylus khobarensis HAAS, 1957
Tropiocolotes - 10種 カワラヤモリ
Stenodactylus ハリユビヤモリ属 - 13種 ペトリボウユビヤモリ
Tenuidactylus - 8種
Cyrtopodion - 28種
Agamura persica (DUMÉRIL, 1856) クモヤモリ
Bunopus - 4種 ツブハダイワチヤモリ
Crossobamon - 2種
Perochirus シマヤモリ属 - 3種 ミナミトリシマヤモリ
Urocotyledon - 5種
Ebenavia - 2種 クチボソツメナシヤモリ
Paroedura ササクレヤモリ属 - 18種
Ailuronyx - 3種
Calodactylodes - 2種 ギュンターシマヤモリ
Ptenopus - 3種
Narudasia festiva METHUEN & HEWITT, 1914
Uroplatus ヘラオヤモリ属 - 14種
Phelsuma ヒルヤモリ属 - 52種
Rhoptropella ocellata (BOULENGER, 1885)
Lygodactylus コビトヤモリ属 - 62種 カンムリマルメヤモリ
Kolekanos plumicaudus HAACKE, 2008
Paragehyra - 2種
Christinus - 3種
Afrogecko - 2種
Ramigekko swartbergensis (HAACKE, 1996)
Cryptactites peringueyi (BOULENGER, 1910)
Matoatoa - 2種 サラマンダーヤモリ
Afroedura - 27種
Geckolepis - 3種 チビバクチヤモリ
Blaesodactylus - 4種 ボイヴィンネコツメヤモリ
Homopholis - 4種
Goggia - 8種
Rhoptropus - 7種
Elasmodactylus - 2種
Chondrodactylus グローブヤモリ属 - 4種 グローブヤモリ・ビブロンヤモリ
Colopus - 2種 Colopus wahlbergii
Pachydactylus フトユビヤモリ属 - 54種 トラフフトユビヤモリ・ミズカキヤモリ
Cnemaspis - 117種、多系統。アフリカマルメスベユビヤモリ等
（Wikipediaより）
