農家や農場が集まって結成されている組織。一般には、農協とJA（全国組織を組んでいる農協。Japan Agricultural Co-operativesの頭文字）は混同されがちであるが、JAに属さず、地域内で活動する独立系農協も多くある。
JAの主な事業には、次のようなものがある。
- 組合員の生産物（農産物）の販売（販売事業）
- 肥料、農薬、農業機械や生活に必要な食品などの供給（購買事業）
- 貯金、貸付、証券業の取り扱い（信用事業）
- 保険に相当する業務 （共済事業）
独立系農協は、JAのような多岐にわたる事業は行わず、農産物の共同販売（消費者や生協への直接販売、直売所の運営など）や、共同での耕作（営農事業）のために運営されているところが多い。
ピクシブ内においては、金融、共済部門にはほとんど触れられず、もっぱら営農事業が注目されているようであるが、これは地域の独立系農協のイメージに近い。
ピクファンや幻想郷にも農協はあるらしいが、これらも恐らくJAに属さない独立系農協であろう。
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V.LEAGUE：女子バレーボールにぎふ農業協同組合（JAぎふ）のチーム・『JAぎふリオレーナ』が参戦。
