この事件の最中、八雲と一緒に救援にやってきた綾小路葉子と出会う。当初から彼女の美貌に惹かれるも、かねてから抱いてたパイへの想いがまだ解消しきれていなかったことと持ち前の異性に対する不器用な言動が仇となって誤解を招き、彼女を怒らせてしまう。しかしその後目の当たりにした彼女の戦闘時のかっこ良さと可憐さに見惚れて完全に恋してしまい、以降は葉子一筋となる。葉子の方も愚直ながらも熱烈なハーンの求愛を受けたことですぐに誤解を解いた上、次第にハーンに惹かれていった。

聖地での人化の法を巡る決戦では序盤から右腕の假肢蠱を武器に八雲と共に活躍するも、そのラストにおいて倒壊する城から三只眼を守るために犠牲となり、生死不明となる。

その後、球城アマラにおいてハーンをベースにして製造されたコピー体「リバース・ハーン」が生み出される。オリジナルから瓜二つの肉体と秘術の知識や技術は継承しているものの、霊力は劣化している。記憶も基本的に受け継いでいないが、葉子に対する強い愛情だけは心の中に刻まれており、それによって度々苦しめられることになる。

一方オリジナルのハーンは致命傷を負いながらも鬼眼王とベナレスによって回収されて肉体と魂に分けられて幽閉されており、後に鬼眼王が葉子に裏切りを唆すための交渉材料として利用する。それに乗って裏切りを決断した葉子はハーンの肉体は手に入れるものの、途中で任務に失敗したことからハーンの魂を得ることはできずに絶望するが、リバース・ハーンの説得を受けて彼と寄り添うことになる。

最終決戦においては蛸のような体（ハーンの頭部から触手のような脚が生えた異形）に魂を込められてパイの拘束具として鬼眼王に利用されるも、後に引き剝がされる。その後の戦闘でベナレスから光牙で攻撃を受けそうになった葉子を秘術のバリアで守るも、弾き飛ばされて葉子共々行動不能となる。葉子と共に最期を受け入れようとするが、このときリバース・ハーンからの提案を受けてサンハーラの力で彼と融合を果たし、精神はオリジナル、肉体はリバースという状態で復活を果たす。その後本編のエピローグでは聖地において葉子と共に農作業をしている様子が描かれ、その畑の傍らにオリジナルの肉体を埋葬した墓が建てられていた。

本編の後日談においてはその後葉子と結婚し、娘の「セツ」を儲けていることが明かされた。

葉子はサンハーラの時点でもまだ八雲への想いが残っていることをハーンに懺悔しながら告白していたが、後日談である短編作品「綾小路家の一日」にて、サンハーラ後に行方不明となっていた八雲を最初にハーンが発見し、その再会を誰よりも喜ぶハーンの姿を見たことで葉子も八雲への想いを吹っ切ってハーンの愛情に応え、自身もハーンを誰よりも愛するようになったことが明かされた。