ただし皇位の継承をしていないため歴代天皇には数えられていない。
天平勝宝2年（750年）?～延暦4年9月28日（785年11月8日）。
生涯
天平宝字5年（761年）に11歳で出家して東大寺に入り、神護景雲2年（768年）には大安寺東院に住む。
宝亀元年（770年）に父の白壁王（光仁天皇）が即位すると、親王禅師と呼ばれ東大寺造営や寺務に携わり、南都寺院において力を持つようになった。
天応元年（781年）に同母兄の山部親王（桓武天皇）が即位すると、光仁天皇の勧めによって還俗し、皇太弟として立太子された。
桓武天皇は延暦3年（784年）11月11日に平城京から長岡京へ遷都し、延暦4年（785年）正月には宮殿で新年の儀式を行った。
遷都の理由のひとつとして、桓武天皇は政治に影響力を持っていた南都寺院を排除したかったのではと考えられている。
しかし、同年8月に伊勢の斎宮となる朝原内親王を見送りに旧平城京へと行幸したひと月後の9月23日夜に「藤原種継暗殺事件」が起こった。
長岡京遷都の責任者であった藤原種継が暗殺されるという事件に、早良親王も連座していたとして廃太子され、9月28日には長岡京の乙訓寺に幽閉され、淡路国への流罪が決まった。
早良親王は無実であることを証明するためとも、朝廷から飲食を停止されたとも言われるが、幽閉から10日余りの絶食に耐え、淡路国に配流される途中、河内国高瀬橋付近で憤死したとされる。
それでもなお桓武天皇は、弟の早良親王の亡骸をそのまま淡路国に運ばせて埋葬させた。
実際に藤原種継暗殺に早良親王が関与していたかは不明である。
没後
早良親王の死から間もなく、11月には桓武天皇の親王である安殿親王（後の平城天皇）が立太子する。
延暦5年（786年）に桓武天皇妃藤原旅子の母・諸姉が死去する。この頃に安殿親王が発病したとされる。
延暦7年（788年）5月に藤原旅子が、翌月に後宮重鎮の皇后宮大夫であった石川名足が死去すると、7月には九州で霧島山が噴火した。
延暦8年（789年）に早良親王と桓武天皇の生母である皇太后高野新笠が崩御する。
延暦9年（790年）には桓武天皇の皇后藤原乙牟漏が病死する。
その後も高津内親王の生母である坂上又子の病死が続き、さらには地震、日照りによる飢饉、疫病の大流行、洪水、伊勢神宮正殿の放火など様々な変事が相次いだ。
延暦11年（792年）年に安殿親王の病気の原因を陰陽寮に占わせたところ「早良親王の怨霊によるもの」であると出たため、早良親王の御霊を鎮めるために幾度か鎮魂の儀式が執り行われた。
延暦12年（793年）年正月14日、桓武天皇は30人の僧を宮中に参内させ薬師経を読ませて、早良親王に鎮謝すると共に、体調不良の続く安殿皇太子の健康を祈願している。
延暦12年(793年)8月、10月、延暦13年(794年)1月、6月、9月と長岡京で立て続けに地震が起こり、射場に怪異現象が出現したことから、長岡京造営から僅か10年後の延暦13年（794年）10月22日に桓武天皇は長岡京から平安京へ遷都し、11月8日には山背国を山城国に改名すると詔を下した。
延暦16年（797年）8月に平安京で地震が起き、延暦19年（800年）3月には富士山が噴火した。7月には早良親王の怨霊を恐れ崇道天皇と追称され、淡路国から大和国に移葬された。その場所は奈良市八島町の崇道天皇陵に比定されている。
延暦24年（805年）4月には祟道天皇を慰霊するために、諸国に小倉を建てて正税40束を納めさせ、あわせて国忌と奉幣の例に加えることが命じられた。
『日本後記』には「怨霊に謝するためである」と記述されており、これが日本の史料上に「怨霊」という言葉が登場した最初の記述とされている。
大同元年（806年）、日本で初めて彼岸会が行われた。『日本後紀』には、崇道天皇のために諸国の国分寺の僧に命じて「七日金剛般若経を読まわしむ」と記述されている。これが彼岸法要の由来・起源がこの彼岸会ではないかとされている。
貞観5年（863年）、神泉苑で御霊会が行われ、祟道天皇は「御霊信仰」で祀られる御霊の筆頭として、現在まで畏敬の念を持って崇められている。
一方で、都をひとつ廃都させるほどの被害をもたらした怨霊は早良親王のみであり、国家・社会全体にもたらした影響の大きさから早良親王は日本三大怨霊を上回る最大・最強の大怨霊ともされる。
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