下位分類
ホソアカメ科 Centropomidae - 1属12種。
タカサゴイシモチ科 Ambassidae （Chandidae） - 8属46種。
アカメ科 Latidae
スズキ科 Lateolabracidae
ケツギョ科 Sinipercidae
モロネ科 Moronidae - ホワイトバスなど2属6種
ペルキクティス科 Percichthyidae -
ペルキリア科 Perciliidae - 1属2種。
ホタルジャコ科Acropomatidae -
カワリハナダイ科 Symphysanodontidae - 1属6種。
イシナギ科 Polyprionidae - 2属5種。
ハタ科Serranidae -
オニハタ科Centrogeniidae - オニハタのみ1属1種。
オニガシラ科 Ostracoberycidae - 1属3種。
シキシマハナダイ科 Callanthiidae - 2属12種。
メギス科 Pseudochromidae - 4亜科20属119種。
グラマ科Grammatidae - 2属12種。
タナバタウオ科 Plesiopidae - 2亜科11属46種。
ノトグラプトゥス科Notograptidae - 1属3種。
アゴアマダイ科 Opistognathidae - カエルアマダイなど3属78種。
ディノペルカ科Dinopercidae - 2属2種。
チョウセンバカマ科 Banjosidae - チョウセンバカマのみ1属1種。
サンフィッシュ科 Centrarchidae - オオクチバス・コクチバス・ブルーギルなど3亜科8属31種。
ペルカ科 Percidae -
キントキダイ科 Priacanthidae - キントキダイ・ホウセキキントキ・クルマダイなど4属18種。
テンジクダイ科 Apogonidae -
ヤセムツ科 Epigonidae - 6属25種。
キス科 Sillaginidae -
キツネアマダイ科 Malacanthidae -
アクタウオ科 Lactariidae - アクタウオのみ1属1種。
ディノレーステース科Dinolestidae - ロングフィンパイクのみ1属1種。
ムツ科 Scombropidae - 1属3種。
オキスズキ科 Pomatomidae - オキスズキのみ1属1種。
ネーマティスティウス科Nematistiidae - ルースターフィッシュのみ1属1種。
シイラ科 Coryphaenidae - 1属2種。
スギ科 Rachycentridae - スギのみ1属1種。
コバンザメ科 Echeneidae - コバンザメ・クロコバン・シロコバンなど4属8種。
アジ科 Carangidae - コバンアジ・イケカツオ・マアジ・ブリなど4亜科32属140種。
ギンカガミ科 Menidae - ギンカガミのみ1属1種。
ヒイラギ科 Leiognathidae - ヒイラギ・オキヒイラギ・コバンヒイラギ・ネッタイヒイラギなど3属30種。
シマガツオ科 Bramidae - シマガツオ・ヒレジロマンザイウオ・ベンテンウオ・リュウグウノヒメなど2亜科7属22種。
ヤエギス科 Caristiidae - 2属5種。
ハチビキ科 Emmelichthyidae - ハチビキなど3属15種。
フエダイ科Lutjanidae - フエダイ・ハマダイ・スジタルミ・アオチビキなど4亜科17属105種。
タカサゴ科 Caesionidae - タカサゴなど4属20種。
マツダイ科 Lobotidae - 2属5種。
クロサギ科 Gerreidae - クロサギ・ダイミョウサギなど8属44種。
イサキ科 Haemulidae - イサキ・コロダイ・コショウダイ・シマセトダイなど17属145種。
イネルミア科Inermiidae - 2属2種。
イトヨリダイ科 Nemipteridae - イトヨリダイ・ヒトスジタマガシラなど5属64種。
フエフキダイ科 Lethrinidae - ハマフエフキ・シロダイ・ノコギリダイ・メイチダイなど5属39種。
タイ科 Sparidae - マダイ・チダイ・キダイ・クロダイ・ヘダイなど33属115種。
ケントラカントゥス科 Centracanthidae - 2属8種。
ツバメコノシロ科 Polynemidae - ツバメコノシロなど8属41種。
ニベ科Sciaenidae - ニベ・シログチ・オオニベなど70属270種。
ヒメジ科Mullidae - ヒメジ・アカヒメジ・ヨメヒメジ・マルクチヒメジ・オジサンなど6属62種。
ハタンポ科 Pempheridae - キンメモドキ・ミナミハタンポなど2属26種。
アオバダイ科 Glaucosomatidae - 1属4種。
レプトブラマ科 Leptobramidae - ビーチサーモンのみ1属1種。
ソコニシン科 Bathyclupeidae - 1属5種。
ヒメツバメウオ科 Monodactylidae - 2属5種。
テッポウウオ科 Toxotidae - 1属6種。
マルスズキ科 Arripidae - 1属4種。
ディチスティウス科 Dichistiidae - 1属2種。
イスズミ科 Kyphosidae - メジナ・イスズミなど5亜科16属45種。
スダレダイ科(？) Drepaneidae - 1属2または3種。
チョウチョウウオ科 Chaetodontidae - 11属122種。
キンチャクダイ科 Pomacanthidae - 8属82種。
エノプロスス科Enoplosidae - オールドワイフのみ1属1種。
カワビシャ科 Pentacerotidae - カワビシャ・ツボダイなど3亜科7属12種。
ナンダス科 Nandidae - 3亜科4属21種。
ポリケントルス科 Polycentridae - リーフフィッシュなど4属4種。
シマイサキ科 Terapontidae - シマイサキ・コトヒキ・ヒメコトヒキなど16属48種。
ユゴイ科 Kuhliidae - ユゴイ・オオクチユゴイ・ギンユゴイなど1属10種。
イシダイ科 Oplegnathidae - イシダイ・イシガキダイなど1属7種。
