※本記事はこの映画のネタバレを含みます。というか存在そのものがネタバレです。
概要
『七夜の願い星ジラーチ』のラスボス。ゲームには未登場でアニメオリジナルのキャラクター。
バトラーがマグマ団にいたころ、破片の化石を使ったグラードンの復活を実行したが、失敗に終わり追放された。
それを見返すべくファウンスでジラーチの力を使いグラードンを復活させたがまたも失敗し、現れたのはグラードンそのものではなく、（ポケモン図鑑で知られる体躯の）グラードンよりも数倍巨大なゴジラ並みの体躯を持つ、グラードンを模した異形の怪物だった。このような結果になったことついてはバトラーも「私が復活させたかったのは、こんなモノじゃない…。」と漏らしていた。
その強大な力でファウンスの森を枯らし、さらには爪や刺を変化させた流体の触手で、ポケモンやサトシの仲間たちまで吸収してしまった。
最終的にはバトラーの協力とサトシたちの行動、そしてジラーチの「はめつのねがい」によって倒された。
シリーズ全体から見ても『時を超えた遭遇』に登場したセレビィゴーレムや巨岩ジガルデと並びシリーズでも隕石に次ぐ最大最強最悪の敵の呼び声が高い。もっとも、アローラの各地から視認性できるウルトラネクロズマの方が巨大であるが敵ではない。
類似キャラクター
このメタ・グラードンのモデルは、ジブリ映画『もののけ姫』終盤で、奪われた自身の首を探すデイダラボッチ（シシ神の夜の姿）と噂されている。
枯れる森、触手や不規則に発光する肉体、終盤での熔け落ちてくる等の描写がよく似ており、ジラーチを探すメタ・グラードンの挙動も首を探すデイダラボッチと似ている。
ただしデイダラボッチは最終的にアシタカとサンによって首を取り戻すが、メタ・グラードンは上記の通り倒された。またメタ・グラードンの触手に吸収されたポケモンやハルカたちは無事生還したが、デイダラボッチの触手や体液に触れた者は残らず死亡している。
また、任天堂作品、青い体液によって内部に捕らわれたポケモンや人間が赤く見える、終始緊迫した状況や仲間のパーティ構成から『MOTHER2』のギーグを思い出す人も多い。余談であるが、映画公開日の約1か月前に『MOTHER1+2』が発売されたため、連想を思わせるのはこれだったということもある。
同じポケモンのタイアップ作品電撃ピカチュウにおけるオリジナルキャラクターであるブラックフォッグと言う個体のゴーストは通常個体とは比較にならないほど巨大、イレギュラーなポケモン、生命力を食らい尽くすと言う所が似ている。
映画公開から10年後に発売された任天堂作品『ピクミン3』にてメタ・グラードンと同じく辺り一帯の養分を根こそぎ吸い取り小動物を補食するヌマアラシが登場している。ただし、ヌマアラシの生態が判明したのは、オリジナル版から7年後に発売された『デラックス』である。またメタ・グラードンに補食されたポケモンやハルカたちは無事生還したが、ヌマアラシに補食された者はルーイは生還したものの、ピクミンは残らず死亡する。
