実家に戻り、ワイナリーの家業を継いだ。だが飛行機を飛ばす夢は捨てきれず、友人のゲオルク=ヘルマン・グライナー(50機(うち46機が夜間撃墜)撃墜の夜間戦闘機エース)と南アメリカでパイロット関連の職業で生計を立てようと決意し、スイスのベルンで南アメリカの外交官と会う為に1946年9月に不法に国境を越えるも会談は失敗し、更にドイツに戻ろうとする際に国境警備隊に逮捕され半年後に釈放される。

1950年7月13日、フランスのボルドーで交通事故に遭い、15日に病院で死亡した。

総撃墜数は121機で、夜間での撃墜数ではドイツ空軍一位の戦果であった。

逸話

●戦歴は一貫して夜間戦闘機パイロットであり、撃墜した121機は全て夜間戦闘で撃墜したもので、1945年2月21日には未明に2機、夜には僅か19分で７機撃墜という腕前を見せている。撃墜戦果のうち114機は搭乗員の多い重爆撃機であることからイギリス空軍に最も甚大な人的被害を与えたとも言われる。

また英米軍機を撃墜した数では158機撃墜のハンス・ヨアヒム・マルセイユ、122機撃墜のハインツ・ベーアに次ぐ戦果となっている。

●英米連合軍の空軍将兵からは、シュナウファー少佐が飛行隊長を務めて戦果をあげた第1夜間戦闘航空団第4飛行隊の駐屯地がサントロンに因んで「サントロンの幽霊」として恐れられた。

1945年の彼の誕生日にはBBCが誕生日祝いとして「幽霊」という30年代のキャバレーソングを送るという英国的ユーモアあるはからいをしている。

●搭乗したのは最後までBf110で一貫していた。シュナウファー少佐のBf110G-4/U-8は戦後にイギリスのハイドパークで展示され、そのうち彼の撃墜数が記録された左舷垂直尾翼はロンドンの戦争博物館で保存されており、シュナウファー少佐が乗っていた他のBf110の垂直尾翼はオーストラリアのキャンベラのオーストラリア戦争記念館にあるという。

●シュナウファーの命を奪った交通事故はワインの買い付けでフランスを訪れていた際に起こったものであり、メルセデスベンツW191のオープンカーで幹線道路を走行中に、ボルドーの南で不法に幹線道路に侵入してきたジャン・アントワーヌ・ガスクの運転する空のガスボンベを載せたルノー22トラックと衝突するものであった。

衝突でメルセデスベンツは発火したものの幸いすぐに消し止められたが、収容されたシュナウファーは頭蓋骨骨折の意識不明の状態であり、そのまま二日後に収容された病院で死去した。

夜間戦闘撃墜数二位のヘルムート・レント大佐、三位のハインリヒ・プリンツ・ツー・ザイン=ヴィトゲンシュタイン少佐、五位のマンフリート・モイラー大尉など多くの夜間戦闘機エースが生きて大戦を終えれなかったなか、厳しい戦争を生き残ったドイツ夜間戦闘機一位のエースの呆気ない最期だった。

死因である頭蓋骨骨折は衝突の激しさを考慮してもそれが原因とは考えにくく、相手の載せていたガスボンベが頭部を直撃した為と推測された。

事件後、裁判で事故当時ガスクは通行権を譲らず、速度も早かったとして有罪とされた。

●1957年12月に故郷のカルフで新たに開発されたヒューデマン地区の通りに地元の英雄としてシュナウファーの名前が冠せられた。