概要
通路と最奥部に分かれている。
ショウヨウシティで化石の話を聞きつけて訪れる。ここではフレア団との初対決もある。
通路部分は複雑な迷路になっているが、分かれ道は基本的に直進すれば最奥部にたどり着く。分かれ道で横道にそれるとアイテムが見つかる(技マシンや、メガストーンもある)
最奥部では岩を壊すとポケモンの化石が見つかることがある。殿堂入り前はひみつのコハクだけだが、全国図鑑になると他の地方の化石も見つかるようになる。
出現ポケモン
ここでは珍しく通常のランダムエンカウントはない。
特有のエンカウントとして、通路部分では先が暗闇になっているところがあり、これに触れると[!]の吹き出しが出て野生ポケモンが出てくる。出現するのはガルーラ、ワンリキー、クチート、サイホーン、ルナトーン、ソルロック、イワーク、カラカラの8種類で、じめんタイプや無進化が多い。
奥にある発掘現場のエリアでは岩を壊した時のエンカウントでイワークの他にイシズマイが現れることがある。そのほか、天井から落ちてくるエンカウントがあり、コロモリとテッシードが現れる(映し身の洞窟でも出現)。
どちらも個体シンボルのように一度倒すとその場から消えるが、通路と発掘現場のマップを切り替えればランダムで復活する。