本作の主人公。成績がちょっとだけ良いだけのこれと言って特徴のない男だったが、たまたま通学路が祠の近くだったため魔法少女に誘われる。男から女に変身することに関して抵抗が無いようで、違和感がある、という感想を抱くのみだった。変身後の格好は主人公曰く、漫画に出てくる本好きな内気な女の子のよう。漫画版では黒髪長髪メガネっ子かつセーラー服の上にカーディガンという格好になった。

使う魔法は意のままに操れる剣・アンサラーと必中の槍・グングニールを召喚する魔法。後に自分の複製を生みだす魔法・ドッペルゲンガーも使えるようになる。

大規模侵攻編で致命傷を受けてからは変身を解かずに生活をしている。そのため市街地奪還編以降は直接戦闘の描写は少ない。

ちなみにだが友達を作るのが苦手。また部活もいつのまにか入部期間を過ぎていて入っていない。

好物は砂糖たっぷりのレモンティーとチョコチップメロンパン。

万条勝太/シキ

ガーディアンの一員。趣味はゲームで主にFPSを嗜む。ゲームの腕はそこまで高くなく、あくまでも楽しむモノと認識している。魔法少女になったきっかけは侵略者に襲われていたところを主人公に助けられたから。それ以降主人公には少なからず恋愛的な好意があるように表現されている。

使う魔法は作中内に登場するゲーム・「R&RY（リトライ）」の武器・オールドマンを生みだし使える魔法。見た目は普通のリボルバーだが侵略者相手には基本一撃で倒すことができる。また建造物にダメージを与えない特性もあり重宝されている。

変身後の格好は金髪ツインテールにスクール水着。本人曰く「自分が使っているキャラにそっくり」とのこと。

好物は緑茶とチキン南蛮カレー。

河城進/ニトリ

ガーディアンの一員。ロボコンに魅せられた小学五年生。他二人とは違い魔法少女ではなく魔法少年に変身する。

魔法少女になったきっかけは万条勝太と同じく侵略者に襲われてたところを助けてもらったから。

使う魔法は自由自在に操れるメカアームとそこから繰り出されるビーム。後に巨大ロボットを召喚できるようになる。

変身後の格好は赤い作業着に青い髪、緑色のキャスケット、大きなリュックをしょった姿。名前といい格好といい能力といい、ほぼほぼアレである。

好物はコーラとBIGハンバーガー

ノワール

ガーディアンのマスコット的キャラ。見た目は執事衣装を身に包んだ黒いうさぎ、触り心地はスライムに近い。

主人公たちの特訓に付き合ってくれたり、主人公たちがその時欲っしてるものを必要に応じて出してくれたり、好みを把握してごちそうを用意してくれたり優秀なサポーター。

魔法少女マジカルフェアリーず

桜田千春が侵略者もとい本好典に対抗して結成した魔法少女グループ。

主な目的は侵略者（ガーディアン）排除による街の平和の維持。

変身後の衣装は統一されていて王道魔法少女風になっている。

桜田千春/ソラ

魔法少女マジカルフェアリーずのリーダー的存在。主人公達の通う中学校の生徒会長。県内トップの成績、テニス部エース、誰にでも優しく常に向上心を持つパーフェクト美少女。学校内に非公式ファンクラブがある。

魔力量も非常に多く、そこを見込まれプランに魔法少女に誘われる。

使う魔法は炎を操る魔法。彼女の熱量に応じて炎の大きさが大きくなる。だが作中では炎をまとったパンチを行うのみで基本的に魔法による技を使わない。彼女の必殺技は魔力を拳に込めた純粋なパンチ。主人公は初戦で一発のみ受けてしまいダウンして敗走しまう。またマッハ3で飛ぶグングニールを見切る動体視力も持ち合わせている。耐久力も非常に高く主人公達は基本的に不意打ちでしか勝利したことは無い。名実ともに最強の魔法少女である。

蒼井夏美/スイカ

魔法少女マジカルフェアリーずの一員。桜田千春とは小学校からの親友で、桜井小春が唯一心の底から信用している相手。桜田千春ほどではないが成績優秀で運動神経もよい。桜田千春に好意を抱いておりファンクラブ設立者。魔法少女になったきっかけは桜田千春に相談されたから。

使う魔法は水を操る魔法。後に液体と認識したものを操れるようになる。

菊地原椛/サクヤ

魔法少女マジカルフェアリーずの一員。主人公たちと同じ中学校に通う普通の生徒。生徒会長軽くを推している。生徒会長ファンクラブ会員で会員ナンバーは16。魔法少女になったきっかけは生徒会長を追っていたところ侵略者に襲われたのを救って貰い魔法少女になる。

使う魔法はケガを癒す魔法。しかし基本的にマジカルフェアリーず側がケガすることはほぼ無く、ケガをした場合はそのまま負けてガーディアンに逃げられるので戦闘中に役立つことは無かった。そのことをコンプレックスに思っていた。第二形態を獲得し一時的に不死身の肉体を手に入れれるようになったことによりそのコンプレックスは解消された。

プラン

桜田千春を魔法少女にさそったマスコット的キャラクター。見た目はタンクトップを着たニワトリ、触り心地は石に近い。対となるノワールと違い桜田千春を魔法少女にした後は基本的に何もしていない。侵略者の現れる位置をたまにつぶやくだけである。しかも現れてから3分後ぐらいにつぶやくため魔法少女は遅れてくることになる。しかも、他の魔法少女の契約は桜田千春に任せていた。『大規模侵攻編』以降は全てをノワールに任せるという書置きを残して帰ってしまった。

新生ガーディアン

『市街地奪還編』後に設立された魔法少女隊「対特殊生物兵器部隊」、通称「ガーディアン」のこと。大規模侵攻を受け国から補助を受けることになった。ただしあくまでも独立した組織として動いている。旧ガーディアンと魔法少女マジカルフェアリーずが合併したためそれ以前と区別される。魔法少女を常に募集しており、入隊した時期によって〇期生と区別される。組織の目的は侵略者に奪われた市街地を奪い返すこと、そして侵略者から日本を守ること。

宇白スズ/アゲイン

新生ガーディアン2期生。『市街地奪還編』のではこの人の視点で物語が進む。作中内に登場するゲーム「RISE（ライズ）」のトッププレイヤー。もともと引きこもりだったが漫画を買いに行こうとしたところ大規模侵攻に巻き込まれる。自分を変えたいという気持ちと大規模侵攻の時に助けてもらった主人公みたいになりたいという気持ちを持って新生ガーディアンに志願する。

使う魔法は「RISE」に登場する武器を扱える魔法。見た目は変身ごとに変わる。

宇白ユキ/スイート

新生ガーディアン3期生。宇城スズの妹。黒木由紀の友人。使う魔法は周囲の敵とみなしたものを眠らせる能力。

九十九響子/ミスティ

新生ガーディアン3期生。黒木由紀の友人。使う魔法は曲に合わせて効果が変わる魔法。

天使

魔法少女と敵対する組織。神から力をあたえられた者達を指す。魔力ではなく神力と呼ばれる力を使っている。

目的は魔法少女の根絶。

今のところ全員本名が出ておらず、魔法少女と相対した時に名乗る二つ名とコードネームしか判明していない。

神

基底世界の創造主。神の力で人を集め、魔法少女と侵略者に対抗する力を与えた。世界の運営のことをプログラミングと魔法少女をこの世界のバグと言っている。

禁断紅帝/スカーレット

天使の一人。身長180cmの王冠をかぶり赤いシャツに赤いマントを羽織った男。その正体はカードゲーム界不敗の男、緋色の王スカーレット（プレイヤーネーム）。余りの強さからついた二つ名が「必勝の頂」「奇跡を起こす者」。余りの強さに全てのカードゲーム大会から出禁を食らっている。圧倒的な王な風格があり、人によっては相対した時に自然と跪くほど。また魔法少女と相対するときの二つ名はこのキャラがつけたものである。

能力は作中内カードゲーム「決闘王（デュエルキング）」に登場するカードを使える能力。また魔法少女と戦うときは特別なフィールドを展開しカードゲームでの決着をそのまま勝敗に適用させる能力もある。その時のルールが「ノーリミット（無制限）」、使うデッキは最凶最悪のアンフェアデッキ「運命リセット」。

コードネームの由来はカードゲームのプレイヤーネームからそのまま取っている。