アーケードそのままとは当時のファミコンの性能ではいかずアレンジ移植版となっている。とはいえ、ウェポンセレクトの導入や前作ではできなかった「オプション4つ装備」ができるようになった。ちなみにオプションを4つ装備して再びオプションを選択すると一定時間ローリングオプションになる仕様となっている。また、ファミコンでありながらパワーアップボイスがある。

シールドは選択制ではなく「フォースフィールド」のみ。

人工太陽ステージとモアイステージ以外はほぼ全てファミコンオリジナル曲になっているが、こちらはこちらで評価は高い。何故かボス曲「Take Care!」はラスボス専用となり、各ボスには例の蟹のテーマ「The Final Enemy」が設定されている。

ファミコンであるためオミットされたボスがいくつかあり、特に火山面とクリスタル面が合体した事でFC版『沙羅曼蛇』同様デスMk-Ⅱが登場しない他高速面が要塞面の一部に組み込まれたことでグラディウスⅡで初登場のビッグコアMk-Ⅱが出てこない。

・・・ところが、実はビッグコアMk-Ⅱはファミコンでも意外な作品で実は登場している。それはファミコン版『がんばれゴエモン2』である。凄く小さくなっての登場だが、ちゃんとカバーを開いてレーザーを撃ってくる。

逆にオリジナルボスの存在がありステージ2のボスだったビッグアイが中ボスに格下げとなり同ステージのボスとしてファミコン版『沙羅曼蛇』にも登場した頭蓋骨型生命体ギーガが登場した（沙羅曼蛇では縦スクロール仕様だったが本作では横スクロール仕様になっている）。

エンディング曲はオリジナル版と違いロングバージョンアレンジになっている。

PCエンジン版

8Bit機への移植ながら、高い技術力とSuperCD-ROM²の大容量を活かして基本はアーケード版に準じながらもオリジナルステージとして遺跡ステージを追加して全9ステージ構成となり、遺跡ステージのボスとしてオリジナルボスのデザートコアが登場した(裏技でアーケード仕様のモードあり)。また、新規制作によるオープニングデモやEDが各難易度に合わせて用意されていたりと細かいチューニングもされている。ただし、GOFER艦内など背景が複雑に描画されたステージなどは一部再現されていない。高速迷路は2重スクロール処理がしやすい様に奥の背景描写が簡略化され、またエイリアンステージも微細ながら背景に差違がある。

SE関連は内蔵音源での制作になり、ボイス関係もアーケード版のものではなく、新規に録音されたものが使用され、追加された遺跡ステージやEDなどでは新規ボイスも使用された。

2020年3月に発売されたPCエンジンミニの国内版・海外版共に本作の国内版がCD-ROM²ソフトの一本として収録されている。