最終回で音無はSSSの卒業式を行い、ゆり・日向・直井の旅立ちを見送る。だがこの後音無は奏と二人になったらいきなり彼女に『一緒に残らないか?』と誘い同時に奏に告白するが、奏は好意に応える一方で音無が奏に心臓を提供したドナーであるということを明かす(タイトルが『Angel Beats!(天使の鼓動)』であったり、音無の本当の記憶が戻ったのはこのため)。

ドナーである音無に感謝を伝えることのみが奏の心残りであったが、ドナーと出会い感謝も伝えられたことで既に世界を去ることを決意しており、音無は泣きじゃくりながら奏に消えないでくれと懇願する。結局奏は音無の告白で心を満たされて消滅。音無が泣き叫んでそのままEDへ…という流れ。この一連の行動は傍から見れば『結局奏と一緒に居たかっただけ』『仲間をみんな消しといてなんだそりゃ』とも取られるものだった。

視聴者の間でも賛否が分かれているが、擁護派の言葉の1つに「音無がやっと我儘を言ってくれて嬉しかった」というものがある。振り返ると、音無が取った行動はすべて「自分以外の誰か」の為のものだった。バイトに明け暮れたのも妹の為、医者を志したのも苦しむ人々の為、事故現場で奔走したのも同じ境遇の人々を助ける為、死の直前にドナー登録をしたのも誰かを助ける為、そしてSSSの仲間と奏の間を取り持ったり成仏させようとしたりしたのもみんなの心を救う為だった。そんな常に人の為に生き続けた男がようやく見せた「我儘」が、あの場面だったのかもしれない。

しかしながらゆりの次に消えようとして日向に止められたことから分かるように、最初から音無自身も消えるつもりであり、愛する者との別れを目前に気の迷いが生じたと言うのが真相である。また奏が消えることを知りつつも彼女の求めに応じて繰り返し想いを伝えており、最終的には悲しみながらも別れを受け入れている。

ちなみに、ED前の光を音無が成仏している様子と捉えるかどうかによってCパートが変わってくる。（パラレル設定参照）

TVアニメ版では成仏したことになっており、音無の転生後と思われる青年が奏そっくりの少女に街中で偶然見かけ、何か思うところがあって声をかけようとするというCパートにつながる。

※ちなみに、ABの世界の設定上、成仏をした後である転生後は互いに対する記憶が無いと思われる。

パラレル設定

DVD7巻の特典映像には第13話のCパートのアナザーストーリー（約2～3分間）が収録されており、こちらでは音無が奏が成仏した後も、今後死後の世界に来た生前に不満がある人達に満足して成仏してもらうために、そのままこの世界に残ったという設定の話になっている。

死後の世界に来たとある人間がパニックを起こし、暴れているところに新生徒会長として現れ、この世界や生前に不満があるなら自分のところに来るように励ます。

13話キャラコメンタリーでの補足

日向からの「この世界に残ろうという提案は、ずっと考えていたわけではなく、本当にその場での思いつきだったのか？」という質問に対し、

「なんていうか、その場の思いつきだけに浅はかだったよ。みんなを諭しておいて、それを否定するようなことを言っちまった。でも、その時は本気でそうしたいって思ったのも嘘じゃなくてさ、つまりさ、それはさ・・・・」

と答えている。

この答えに対して、ゆりは「愛ね」と断言し、日向は「奏ちゃんを想う気持ちだったって事だな」と返している。

外部出演

「3週続いた学園祭も今回でついにラストだ。あ？お前は誰だって？それは後のお楽しみってことで」

Keyの主要作品のクロスオーバーギャグアニメ『かぎなど』の最終話にゲスト登場。

前述の冒頭のナレーションのみでの登場だが、この声を聞いたファンの中には『AngelBeats!』参戦を察した人も多いはず(神谷浩史は『AngelBeats!』以外のKey作品で主要キャラクターとして登場していないため)。その後、日向の乱入やゆりが変装を解いたのと同時に姿を見せる(この時、キャストクレジットにも名前が出てきている)。

その後、4月12日放送のシーズン2より正規参戦する。

毎回神への復讐のため行動を起こすが天使のスキルによって吹っ飛ぶ、運転手や特定の生徒たちのトラウマが想起されパニックになったバスでバスジャックを起こそうとするも、トンネルに入って自身のトラウマを思い出し、そのまま次回が終わるまで行動不能になる(ただし、そのせいでバスジャックを起こさなかったためか、同席していた日向・直井と共に生き埋めの刑は回避している)、など本編以上に損な役回りが多い。

ゆり達よりはおとなしいためか、第20話のラストシーンで行われた主人公一同の覆面座談会にさらっと参加していたり、最終話で他の主人公達と楽しそうに会話していたりと他作品キャラとの関係は良好。