専攻	雄弁術
モットー	『鋭いペン先、さらなる鋭知』
マスコット	墨獣（インクで生み出された使い魔）
創始ドラゴン	シャドリクス・シルバークイル

洒落ていて、威圧的で、意欲的なシルバークイルの魔道士は言葉の魔術を使う。言葉を手足のように使い戦闘詩や書き言葉の魔法的顕現から呪文を作り出し、ルーンのインクで宙に模様を書き込む。

プリズマリ大学

専攻	精霊術
モットー	『精霊とともに自己表現を』
マスコット	エレメンタル
創始ドラゴン	ガラゼス・プリズマリ

芸術を好み、魔術を最高の自己表現の手段と考える芸術家な魔道士たち。彼らの呪文は、創造性の発露や緻密な芸術表現であり、プリズマリの者たちにとっては世界すべてが芸術の舞台である。

ウィザーブルーム大学

専攻	本質学
モットー	『自らの手で取り組め』
マスコット	害獣
創始ドラゴン	ベレドロス・ウィザーブルーム

生者を癒し森を生やし、腐敗と死の力を使いゾンビワニを乗りこなす生と死の対立から力を引き出す生物学の専門家たち。

ロアホールド大学

専攻	考古術
モットー	『石を残らずひっくり返して探せ』
マスコット	霊魂（スピリット）
創始ドラゴン	ヴェロマカス・ロアホールド

熱心な研究者と大胆な冒険家たち。歴史に熱中する情熱的な学者たちは、考古学的な工芸品に埋もれながら歴史的人物の魂を召喚するなどして過去について研究する。

クアンドリクス大学

専攻	数魔術
モットー	『数学こそ魔法』
マスコット	フラクタル（※自然の幾何学模様を抽象化した人工生命体）
創始ドラゴン	ターナジール・クアンドリクス

創意工夫に富む自然数学者たち。彼らは幾何学模様、フラクタル、対称性を研究することで、自然の基礎的な数学を操る力を振るう。

エキスパンション『ストリクスヘイヴン：魔法学院』

スタンダード用のエキスパンション。2021年4月23日発売（アリーナやMOでは同月15日）。

「ゼンディカーの夜明け」「カルドハイム」同様に今回もモードを持つ両面カードが登場する。

新たに登場したメカニズムとして

魔技：インスタントやソーサリーである呪文を唱えるかコピーするたび誘発する誘発型能力
履修：ゲーム外（ルールやフォーマットを定めた試合ならサイドボード）から『講義』というカード・タイプ持つカードを手札に加える、もしくはカードを1枚引いて1枚捨てるという意味

が存在する。

また、背景ストーリーでの5つの大学に合わせ多色、特に対抗色が取り上げられているのも特徴。

大学	色の組み合わせ	ゲームでの特徴
シルバークイル大学	白黒	アグロ、+1/+1カウンター
プリズマリ大学	青赤	重いインスタントやソーサリー、それの使用を補佐するマナ加速
ウィザーブルーム大学	黒緑	ライフを参照とするものや回復、生贄
ロアホールド大学	白赤	墓地利用、スピリット
クアンドリクス大学	青緑	数字に関する効果、土地展開

その大学と関りが深いカードには各大学のシンボルの透かしが入れられている。

ミスティカルアーカイブ

マジックの歴史から厳選された63種類のカードが古文書を意識した特別なフレームとアートスタイルのイラストで収録されている。

ストリクスヘイヴン：魔法学院の各種ブースターパックに封入されるが、カード・セットとしてのストリクスヘイヴンには含まれず独自のエキスパンション・シンボルとコレクター番号を持つ。

背景ストーリー的には『ストリクスヘイヴンのあらゆる知識や呪文が収められた大図書棟に治められた多元宇宙の呪文の複製』という扱いになっている。

未開封のパックを開けてその場でデッキを作るリミテッドでは、封入していた場合のみ使用可能だが、あらかじめ自由にデッキを作る構築ではその同名カードが使用可能なルールでないと使用不可。

剣を鍬にや対抗呪文、暗黒の儀式と言った有名カードの特別イラストも収録されているが、スタンダードでは再録されていないので過去カードが使用可能なルールでないとデッキに入れることはできないとなっている（ただし、アンコモンで収録されたものはストリクスヘイヴン：魔法学院発売登場のスタンダードで使用可能なカードが選出されている）。

さらに63種類のカードには日本画バージョン『日本画ミスティカルアーカイブ』が存在する。日本語版しか存在せず、枠無し拡張アート仕様でカード名が縦書きとなっている。イラストも和風アートスタイルであり、日本人のイラストレーターが担当している（これに対して通常のミスティカルアーカイブはグローバル・バージョンと呼ばれる）。日本語版のドラフト・ブースターかセット・ブースターに、50%の確率でグローバル・バージョンの代わりに封入されている。コレクター・ブースターには言語に関わらず最低1枚が封入されている。