あらすじ
伝説の忍者たちと会える!?「夢の忍者ランド」からの招待状が届き、ニンニンジャーは期待に胸をふくらませて出発した。しかし、彼らが乗ったのは、なんと妖怪烈車！妖怪ワニュウドウが見せる幻覚で、天晴たちはピンチに陥ってしまう。そこへ現れたのは、かつて世界を闇で包もうとする悪の路線・シャドーラインと戦い、これを倒した烈車戦隊トッキュウジャーだった。
彼らによれば「夢の忍者ランド」は、本当は「闇忍者ランド」。シャドーラインの残党・闇博士マーブロが、伝説の忍者の「闇クローン」を作るため、ニンニンジャーをおびき出したのである。天晴＝アカニンジャーが闇のオーラに包まれ、そこからハイブリッド忍者「闇アカニンジャー」が誕生！このままでは天晴の忍タリティが失われ、天晴自身も消滅してしまう……。今こそ、２大スーパー戦隊が力を合わせるとき。忍タリティとイマジネーション、そして「家族を想う力」で、最大の危機に立ち向かえ！！
登場人物
スーパー戦隊と仲間達
かつてシャドーラインから地球を守ったスーパー戦隊
ちなみに今回車掌は、演じている関根勤氏のスケジュールが合わなかったためか、未登場。ワゴンも中の人が忙しかったのか、登場しない。
トッキュウジャー本編ではEDダンスはなかったが、本作のエンディングでトッキュウジャーの6人がニンニンジャーと一緒にEDダンスを披露している。
恒例の先行お披露目に登場。
敵サイド
牙鬼軍団の小姓。闇博士マーブロと結託し、クライナーから妖怪ワニュウドウを作り出す。
十六夜九衛門が用意した封印の手裏剣とクライナーと融合して誕生した妖怪。ニンニンジャーを闇忍者ランドへ連れて行くための妖怪列車として現れ、幻を操る能力を持つ。
シャドーラインの残党にして、博士兼闇忍者ランドの支配人。頭脳明晰だが、子供っぽい性格で、忍者が大好きなマッドサイエンティストである。伝説の忍者の闇クローンを作り出して手元に置き、最終的には闇クローンをミックスして最強のハイブリッド忍者を作ろうと企む。怪人態に変身すると、左手に巨大な鉤爪を装備する。
闇アカニンジャー
マーブロが天晴の忍タリティを奪って開発したアカニンジャーの闇クローン。このため、天晴はアカニンジャーに変身不能になるどころか、消滅の危機に晒される。手足が黒く、胸部の手裏剣のマークが無いなどの差異がある。
超超クライナーロボ
マーブロの乗るクライナーロボに、２体のクライナーロボが合体した形態で怪獣のような姿をしている。口からビームを発射する。
マーブロが作り出した伝説の忍者の闇クローン。
シャドーラインの元幹部ネロ男爵の闇クローン。闇忍者ランドの関所の番人を務める。オリジナルではステッキが武器だったが、錫杖に変わっている。またシルクハットを取ると頭には丁髷が。
シャドーラインの元幹部ノア夫人の闇クローン。闇忍者ランドへ通じるトンネルの番人を務める。オリジナルでは日傘が武器だったが、雨傘に変わっている。
シャドーラインの元幹部シュバルツ将軍の闇クローン。闇忍者ランドへ通じる橋の番人を務める。オリジナルではサーベルが武器だったが、日本刀に変わっている。
