概要
ファンタシースターオンライン2には様々なボスエネミーが登場する。
PSO2esでは、これらのエネミーが人間の姿になった「トランスエネミー」が登場した。
超化エネミー
新難易度「ウルトラハード」に登場するボスエネミーの強化個体。
出現した原因は不明だが、「終の女神シバ」の侵攻と関係があるらしい…
原生種
ロックベア
惑星ナベリウスの森林エリアのボス。…であった。
現在の森林探索のボスはファングバンシー（ファングバンサーのつがい）となっている。
また、クラスのPVや動作テストで登場している死なないロックベアが近い将来実装予定となっている。
スノウバンシー（雌）/スノウバンサー（雄）
惑星ナベリウス凍土エリアのボス。その姿は巨大な白虎そのもの。俊敏な動きで相手を翻弄し、鋭い爪と牙でプレイヤーを引き裂く。また、口からアイスブレスを吐く。同型種にファングバンサー（バンシー）が存在し、そちらは森林エリアに出現する。
龍族
ヴォル・ドラゴン
惑星アムドゥスキアの火山洞窟に登場するボスエネミー。
地面に潜り、溶岩を纏ってパワーアップする。
クォーツ・ドラゴン
惑星アムドゥスキアの浮遊大陸に登場するボスエネミー。
頭から突っ込んで地面にブッ刺さる攻撃を得意とする。
ドラゴン・エクス
惑星アムドゥスキアの龍祭壇に登場するボスエネミー。
ちなみに希少種の「ノワル・ドラール」は若い女性の龍族。
クローム・ドラゴン
「造龍」と呼ばれ、正確には龍族ではないボスエネミー。
主にレアEトライアルで出現。
希少種（ヘイズ・ドラール）とは別に「アポストロ・ドラゴン」というモノがいる（関連性は現在不明）。
機甲種
トランマイザー
惑星リリーパの砂漠エリアに登場するボスエネミー。
ビッグヴァーダー
惑星リリーパの地下坑道エリアに登場する巨大戦艦に酷似したボスエネミー。
海王種
バル・ロドス
惑星ウォパルの海岸エリアに登場するボスエネミー。
浮上施設でもEトライアルで出現。
ビオル・メデューナ
惑星ウォパルの海底エリアに登場するボスエネミー。
黒ノ民
アンジャドゥリリ
惑星ハルコタンの白ノ領域エリアに登場する輪入道に酷似したボスエネミー。
ギグル・グンネガム
惑星ハルコタンの白ノ領域エリアに登場するボスエネミー。
マガツ(禍津)
惑星ハルコタンに封印されていた無数の顔を持つ巨大な悪神。
ダーカー
ダーク・ラグネ
各惑星のエマージェンシートライアルで出現することが多い蟲系ダーカーのボスエネミー。
狭い所が大好き。
ブリュー・リンガーダ
惑星リリーパ「採掘場跡」に登場する蟲系ダーカーのボスエネミー。
ダーク・ビブラス
採掘基地防衛戦：襲来から登場した蟲系ダーカーのボスエネミー。
ダークファルス
ダーカーの親玉ともいえるボスエネミー。
【深遠なる闇】
ダーカーとダークファルスを生み出した存在。
世壊種
アンガ・ファンダージ
壊世区域に登場するボスエネミー。
幻創種
幻創戦艦・大和
EP4序盤のレイドボス。
主にA.I..Sでの戦闘になる。
デウス・エスカ
EP4終盤のレイドボス。
ストーリーで戦うのはレイド版の第一形態「デウス・ヒューナス」。
魔物種
エリュトロン・ドラゴン
異世界オメガに登場するレイドボス。
閃機種
ドラルベルージュ
EPISODE6第1章にて初登場した閃機種のボスエネミー。
超時空エネミー
エンペ・ラッピー
ボーナスクエストとEトライアルでのみ登場する巨大なラッピー。
ニャウ
プレイヤーに戦いを挑んでくるジャコウネコのキャラクター。
コラボエネミー
オーディン
「ファイナルファンタジー14」とのコラボにより登場した闘神。
クーガーNX
「ボーダーブレイク」とのコラボにより登場したブラスト(ロボット)。
一度やられてリスポーンする所も再現。
ガル・グリフォン/グリフォン・ゲルス
PSOに登場したボスエネミー。
超化エネミーに「デオス・グリフォン」が登場。
エルゼリオン
「モンスターハンターフロンティアZ」とのコラボにより登場した「灼零龍(しゃくれいりゅう)」。
トリガークエストでは本家モンハン宜しく古塔で闘う。
第6の使徒
新劇場版ヱヴァンゲリヲンとのコラボにより登場。A.I.Sヴェガに搭乗した状態で交戦する。
