概要
貨物輸送船コギトエルゴスムで、カトゥーによって作られた学習機能付きロボット。
「キューブ」という名前とは正反対の丸っこい外見だが、これは良い名前が浮かばなかったカトゥーがとっさの思いつきで付けたため。
（最初は丸い外見から安直に「コロ」と名付けようとしていた。なお、コロという名前はちゃんと覚えておかないとある場面で詰む可能性もある）
製作過程でカトゥーに便宜上付けられていた通し番号は「プロトタイプ03」で、彼の日記からキューブの前身である01・02の存在も確認でき、02らしき同型のロボットもゲーム中で見ることができる。
ロボット故に何を考えているかは分かりにくいが、
戦闘能力
全体的に攻撃力が低いが、自分と周囲を回復できる"ハイスピードオペ"が使える(HPだけでなくいくつかのステータス異常も回復できる)。
ハイスピードオペは反撃技でもあるため、敵が技を使った後も即座に回復できてとても便利。
主人公達の中では唯一レベルが上がらない（近未来編のタロイモと同じ）為ステータスの変動がなく、HPのみロボット系の敵が落とす強化パーツで上げることができる。
最終編では仲間全員のLvの合計によって出現する敵が変化するため、レベルの上がらないキューブ1人旅を続けていれば弱い敵ばかりと戦える。
逆に一気に仲間を集めると強い敵が出てきてレベルの低いキューブがやられやすくなるので、最初は一人旅や少人数での戦いが安全だろう。
また特定の武器を装備することで技を増やすことができ、中でもヒヨコ弾が発射できる「昭和ヒヨコッコ砲」が強力（ただし装備せずにアイテム欄から使用しても攻撃ができるので、アキラを仲間にしたらもらっておこう）。
余談
キューブの持つ８つの技（『ハイスピードオペ』『アップグレード』『マインドハック』『アンチフィールド』『ノイズストリーム』『インフォサーチ』『スピンドライブ』『メーザーカノン』）をそれぞれ英語にし、頭文字を読んでいくと『HUMANISM（ヒューマニズム）』となる。
……設定によればキューブは作業用ロボットとして造られたようだが、オペはともかくマインドハックやメーザーカノンが必要な作業とはなんなのであろう。
だがSF編の舞台は2099年もしくはそれより後…人が制御しないロボットが人を殺す戦争が行われるような時代である。
自衛のための兵器を標準で搭載しなければならない、という事なのだろうか。
最終編EDでは元の時代に帰還後、回復したカトゥーやダース伍長と再会を果たす場面で締めくくられる。
