特に、本土決戦が現実的になると合理化、簡略化は一層進み初期の銃とは別物のような出来栄えとなった。末期には加工の不良や粗悪な材質の使用によって発砲すれば射手が大怪我をするような欠陥銃が登場する有様だったが、本土決戦が行われなかった為かこの問題は日本軍の間では甚だしい問題になったという証言は稀である。むしろ、これらの銃を持ち帰ったアメリカ人が…

ただ、合理化・簡略化自体は他国でも積極的に行われた。連合国側には「実用上支障がない部分は徹底的に簡略化して頭数を揃える」という方針が見て取れる。

戦後

1950年に発足した警察予備隊（後の自衛隊）にはM1ガーランドと同じ.30-06スプリングフィールド弾仕様に改造された九九式口径.30小銃が配備された。

朝鮮戦争では、韓国軍がアメリカから同様の銃の供与を受けて使用した。

しかしながら、この銃は大戦末期生産の粗悪な銃を乱暴に加工したため、故障などが多発した。

1960年代には、安全装置を掛けても撃発する危険な銃ばかりになり、豊和工業が行った試験では軍用銃として使用できるものは一丁も存在しない有様で、即時射撃停止命令が下され、初級教育の執銃訓練専用となった。

64式小銃が採用されると、一線級部隊において急速に更新された。

ただし、元となった銃や加工方法の不味さの他にも、製造が中止されて20年ちかく経過して予備部品が充分でなかったことに留意する必要があるし、当時陸上自衛隊の主力小銃であったM1ガーランドや、更に古いトンプソン・サブマシンガン、M1917重機関銃などにも経年劣化が激しいものがあり、九九式のみが危険な状態だった訳ではない。

余談

陸上自衛隊で使用されてる64式小銃（64式自動小銃）の開発は、九九式短小銃を開発・製造した、豊和工業が担当している。
小倉造兵廠の刻印が入った銃には、東洋工業株式会社（現在のマツダ）製のものもあった。
1944年10月22日、ビフォンテーヌ（フランス）東でドイツ軍に包囲された第34師団141連隊第1大隊（テキサス州）が第442連隊戦闘団（日系アメリカ人により編成）により救出されたためか、テキサス州では三八式歩兵銃と共に人気があると言われる。