軸となっているストーリー
- スーパーロボット大戦IMPACT
- スーパーロボット大戦A
- 第3次スーパーロボット大戦（隠し最終話除く）
- スーパーロボット大戦α
- スーパーロボット大戦α外伝（ラスボス除く）
- 第2次スーパーロボット大戦α（アラド編、ゼンガー編のみ。アイビス編は前日談）
- ヒーロー戦記（事実上のヒーロー戦記の後日談となっている）
今作は「IMPACT」のアインストと「A」のシャドウミラーを軸にして物語が進む。
キョウスケ、エクセレンとアインストの繋がりや、OG2における「A」のシャドウミラーの設定の関係上、今作もキョウスケが主人公格として扱われ、前作よりも目立った活躍をする。
一方でラミアやアラド、ゼンガー、ギリアムらも主人公格としての活躍を見せるため、インスペクター四天王になぞらえて、「表の主人公」「裏の主人公」「影の主人公」「真の主人公」とあてはめられる事も。
この作品で前作に登場しなかったユウキ・ジェグナンとリルカーラ・ボーグナインが加わり、スーパーロボット大戦αの主人公達の全員集合が果たされた。このα主人公8名が一堂に会するスパロボ作品はゲームとしてはこれが初めてである。
戦闘アニメーションもGBAのスペックに合わせて作り直してはあるものの、α外伝や第2次α等のPS・PS2作品に登場したユニットのものもおおよそ忠実に再現されている。
アニメ『ジ・インスペクター』は本作をベースとして制作されている。
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