藤吉カップ（原作では、ジャパンカップ）にて、多くのレーサーのマシンを破壊していき、独走状態を保つが、星馬兄弟の新たなるマシンに打ち破られ、一度は海へ落ちる。その後、【本当のミニ四駆の走り】に目覚めたJが自らアームリモコンを破壊。彼と共に大神軍団の脱退とバトルレーサーへの決別を果たし、再び走り出す。順位は最下位であったが、新たなる道を歩むことになった。

Jの意向で、自身が破壊したトライダガーXを修復するために部品を取り払われる。当初は、これをもってJ自身と共に【ミニ四レーサー】を引退する予定だった。その後藤吉からタイヤ、豪からモーター、二郎丸から電池を貸してもらいリョウとレースを楽しむ（この時のJBは最初で最後の【レブチューンモーター】採用機）。※アニメでのJ機の活躍は、ここが最後となった。

大神軍団との戦いに備えて、Vマシン、ネオトライダガー、スピンアックスと共にレースに挑む。が、Vマシンとネオトライダガーとの性能の差から限界に達し藤吉と共に新型マシンを製作することになった。※原作でのJ機の活躍は、ここで最後。

原作ではWGP開催・チーム結成時に、アニメ版ではGJC出場時にプロトセイバーEVO.にバトンを渡した。

プロトセイバーバリエーション

プロトセイバー戦隊
- 赤・緑・桃・白・黄の5台（各々のウイングとノーズにカラーを示す頭文字が描かれている）。JBよりもパワーアップはしたようだが、目覚ましい活躍がなかった。

サマーレースは予選こそ全員突破したが、決勝戦では3台は大神の手によって自爆させられ、2台は沖田カイのビークスパイダーが破壊した。再登場時の大神研究所内のテストコースで、レイスティンガーやブロッケンGの相手にされロクに攻撃できず、SGJCビッグチャレンジでは2台はブラックセイバー軍団の妨害に遭い自滅。1台はブラックセイバー軍団の1人・マサと相打ち、最後の2台はジュンとチイコによって吹っ飛ばされ、全滅。

プロトセイバー戦隊が破壊に成功したのはモブマシンやブラックセイバー軍団の一部のみ。

プロトセイバー600
- 市販化されたプロトセイバー。購入したレーサーが走らせているのを烈が目撃している（実は1stOPでも橙色の本機が登場している）。

こっちには、空気砲やアームリモコンによるセッティング変更が可能なギミックが搭載されていない。まぁ、そりゃそうだ。

MAXでは、竜平の同級生「イガミトラヒコ」が使用している。ノコギリローラーをチェーンで延長させるブロック戦法を得意としている。ノコギリローラーを装備したマシン…？

Return Racers!!では、ジュンも使用している。

プロトセイバーTT
- 所有者はTT。カウルが金継ぎになっているのが特徴で、装飾としてだけでなく車体に空気を供給し後部に排出するシステムとしても機能する。

同時に、この金継ぎは訓練中に損傷したプロトセイバーをTTが修復して育てた証でもある。

過去

10年前、土屋と共に「最速のミニ四駆開発」に打ち込んでいた頃に大神がテストコースで走らせていたマシンが本機に近い形状のカウルをしていた。この段階で、大神製フルカウルマシン【プロトセイバー】の完成が間近な状況になっていたが、『試作品として生まれたマシンをもっと大事にしてください、調整をすればもっとよくなります！』　『子供達が求めているのは【完璧なマシン】ではないような気がします』と仲間に言われたが、それに対し『子供達を意識して速いマシンは誕生できぬわ！』と返した。

更に自身のマシン開発方針を説くと仲間が離れ、この出来事で土屋の下を去り独自に研究所（現：大神研究所）を設立、そこで設計・開発したものが本機となった。

誕生した大神製フルカウルマシン【プロトセイバー】は、大神製モーターやバッテリーが搭載されたことで土屋製フルカウルマシン以上のパワーを持つことに成功したが文字通り【化け物】になってしまったため、制御するために「トラクションコントロールシステム」と「アームリモコンによるセッティング」が組み込まれている。