月落下事件の後に土影の座を四代目の黒ツチへと譲り、隠居後はまだ幼い孫の一人・コヅチの成長を楽しみにしながら余生を過ごしていたが、彼はまだアカデミー生のうちに、里を襲おうとした盗賊団を相手に孤軍奮闘した末に落命してしまう。その原因が、自分の「敵を前にしても逃げない強い意志を持て」という教えにあったことから、オオノキはそれを後悔する。そして、大戦後レベルが大きく低下してしまった若い世代が、コヅチのように力不足のまま犠牲になっていくことを憂い、「忍が戦わなくても良くするための人工物による防衛手段の開発」に着手する。

手始めに土遁を応用した自律型土人形「芥」を試作するも、自身の技術では制御が効かず、身内にも協力を得られなかったことから、得体の知れない外部の技術者を秘密裏に誘致し、芥の改良に成功。さらには大戦の負の遺産たる白ゼツの細胞を用いた人造人間「ツクラレ」を試作するに至った。

ただし、ツクラレの欠陥を自力で解消することができず、その対策として同じ人造人間のミツキを非公式に招いたことで、彼を追う木ノ葉隠れの若き忍たちに介入される事態となる。

しかし、思惑に反してツクラレは一号体・空を中心に独自の行動をとるようになり、岩隠れ制圧を目論み反乱を起こすという、本末転倒な状況に。

自身の行為を咎めるボルトと交流する中、コヅチの死を世の中のせいにし現実逃避していたことを自覚し、再び「己を拾う」ことを決意。

完全に暴走を始めた空を止めるべく参戦し、空が放った塵遁に自らの塵遁をぶつけて勝利したが、高齢の身で一度に大量のチャクラを消費したことで遂に限界を迎え倒れてしまう。

薄れゆく意識の中、駆け寄るボルト達に岩隠れ流の「人の意志」について諭し、その生涯を終えた。

五影経験者の醜聞を世間に広めることは憚られたため、彼の死は表向き「老衰による自然死」という事にされ、ツクラレに関する一連の事件への関与は伏せられた（詳細を知るのは事件の当事者となったボルト達、岩隠れ上層部の他、木ノ葉隠れの上層部および上忍の一部、事後報告を受けた他の影 3 人とその側近、ミツキの出身である音隠れの上層部の一部のみ）。

白ゼツの細胞を提供したドクターは「殻」の外陣だったが、オオノキ本人が殻の存在を認識していた様子はなく、後に殻の暗躍とクーデター事件後のドクターの動向を伝えに日向ハナビが黒ツチの下を訪れた際、ハナビは黒ツチの「まさかオオノキのじいさんが殻に関係していたなんてことは…」という疑惑を否定している。