その後は吉良イヅルが治療を行っている結界の護衛に回っていたが、吉良の説得で前線に立ち藍染側に回った東仙と交戦する。しかし虚化や帰刃をも手にした東仙に圧倒され、止めを刺されそうになるが、東仙を慕っていた檜佐木修兵の奇襲によって事なきを得た。そして、東仙と和解しかけたが、直後に東仙は藍染に殺害されてしまい、その後藍染と戦闘を行うが一蹴されて敗北した。

千年血戦篇

星十字騎士団のバンビエッタと対峙。早期決着を狙い卍解するも彼女に奪われてしまった。戦闘でも劣勢になってしまうが、元柳斎の霊圧を感知して部下を鼓舞し奮い立つも右耳を失う重傷を負った。（後に完治）

第一侵攻後、人狼一族の元を訪れ「大爺様(CV：浦山迅)」に一族の秘儀の教えを乞おうとするが拒否され彼と戦闘を行う事となった。

実は狛村が人狼であるのは彼の出生が、生前罪を犯し畜生道に堕ちた一族の出である為。

第二侵攻では山本総隊長の仇討ちの為、一族に伝わる「人化の術」を使用し不死身の体となってバンビエッタと再び戦闘に入る。卍解【黒縄天譴明王・断鎧縄衣】でバンビエッタを一撃で叩きのめして勝利するも人化の術が切れ、術の副作用によって完全な四足歩行の狼と化した。

復讐心に駆られかつての東仙の二の舞になってしまった自分を卑下するが、射場の励ましを受けてともにユーハバッハの元へと向かう。その後の動向は不明だったが、射場とともに行動していることが描かれた。

以降はどうなったのかは描かれず、最終回でも登場しなかったが、小説『WE DO knot ALWAYS LOVE YOU』によると、隊長職を退き（射場により、戦死したと護廷十三隊には説明された。なお、霊圧の残滓から一部は存命に気づいている模様）、人狼一族の狼子を射場のもとに預け、自身は狼として裏山で生活していることが判明した。

呪いのため、人語は話せなくなったようだが、他の人狼とは意思疎通がとれるため、自らが隊長の器として充分か思い悩む射場を励ます言葉を、うるい、ショウマという二匹の狼子を通して伝えた。「隊長」と呼ばれるのは嫌らしく、射場からは「左陣殿」、うるいとショウマからは「左陣さま」と呼ばれている。定期的にうるい、ショウマと一緒に射場のところまで遊びに来たりしている。

狛村のこの末路は寂しくはあるが、対戦相手であるバンビエッタは仲間である筈のジジによってゾンビ化され奴隷にされ、生きてるのか死んでるのか分からない毎日を過ごしていることを考えると、彼女の末路よりはまだマシなのかもしれない。

もっとも、死にたくても死ねない零番隊、死ぬと地獄行きが確実とされる他の隊長、狛村の現状のどれがマシなのかは不明である。