　同年12月、延暦寺天台座主となっていた後醍醐帝の皇子・護良親王、河内の豪族・楠木正成が倒幕の兵を挙げ、護良親王の令旨を得た赤松円心、佐々木道誉らも挙兵、これらの反乱鎮圧に幕府も北条高家、足利高氏を大将として軍勢を京に派遣したが、軍を率いていた北条高家があえなく討死すると高氏は朝廷方に寝返り、赤松円心、佐々木道誉らとともに六波羅を攻略する。

元弘3年(1333年)5月22日、各地に反乱が広がるなか幕府の本拠地・鎌倉が陥落、得宗・北条高時をはじめとする北条一族、長崎円喜ら近臣が自害、鎌倉幕府は滅亡した。

建武の新政

鎌倉幕府の崩壊により、帰京した後醍醐天皇は北条氏に擁立された光厳天皇を廃すると、元号を「建武」に改め、天皇親政を志し、各地に国司・守護を派遣する。

　これにより、陸奥守に親房の長男・顕家を任じ、親房は天皇の第七皇子・義良親王(後の後村上天皇）とともに奥州・多賀城において東北を、成良親王と足利尊氏の弟・直義を鎌倉に派遣して関東の支配に着手した。

その一方で、公家や寺社の所領を安堵したり、恩賞や人事に不公平があったりするなど、各所で武士たちの不満が高まり、新政権への期待はまたたく間に失望へと変わった。

そして南北朝時代へ

武士たちの不満が高まるなか、建武2年(1335年)、北条高時の次男・時行が幕府残党３万を率いて蜂起、足利直義が迎え撃つが敗退し、鎌倉は陥落寸前となる。

　この事態に京より足利尊氏が出陣、尊氏は幕府残党を破るも朝廷からの帰洛命令に従わず、鎌倉にとどまりつづけ、その間、尊氏の弟・直義は味方する武士たちに恩賞を与えつづけた。

業をにやした朝廷は新田義貞らに尊氏追討の命を出す。その報に追討軍を迎え撃った直義軍は敗れ、当初、恭順姿勢を示していた尊氏も迎撃に出陣、追討軍を破って京に進撃、建武3年(1336年)、京において尊氏軍は新田・楠木・顕家連合軍に敗れ、九州に落ち延びていった。

しかし、尊氏は九州で勢いを盛り返す。多々良浜の戦いで朝廷方の菊池武敏を破ると西国の武士を糾合、光厳上皇の院宣も得て摂津国・湊川の戦いで楠木正成が討死、新田義貞の軍勢は四散、逃れた後醍醐帝は吉野に新たな朝廷を立てると親房らもこれに従い、ここに北朝と南朝という２つの王朝が鼎立することとなった。

建武5年・延元2年(1337年)、長男・顕家が伊勢、伊賀を経て大和へと入り、河内・摂津で奮戦するが、和泉国堺浦で高師直に敗れて討死。兄の後を継いで顕信・顕能兄弟は北朝方と戦い、顕能は後に伊勢国司となり、子孫は織田信長に滅ばされるまで伊勢を支配しつづけた。

暦応元年・延元3年(1338年)、南朝の勢いを盛り返すため常陸に向かうが、近隣豪族は誘いに乗らず失敗、吉野に戻る。

正平の一統

足利氏の内紛に乗じて、正平6年・観応2年(1351年)、足利尊氏・義詮父子が降伏、「正平の一統」がなり、後村上天皇らとともに京に還幸したが一時的なものであり、北朝方の光厳上皇・光明上皇・崇光天皇を拉致、後村上帝とともに吉野の賀名生に退却、正平9年・文和3年（1354年）4月17日、その地で没した。

神皇正統記

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北畠親房が登場する作品

小説・伝記

志茂田景樹氏の『南朝の日輪北畠親房』、童門冬二氏の『小説北畠親房南北朝の梟』、岡野友彦氏の『北畠親房　大日本は神国なり』、平泉澄氏の『北畠親房公の研究』など。

マンガ

学研：まんが人物日本史の『足利尊氏』と『楠木正成』。前者では白い頭巾で頭を覆った僧兵のような姿で登場、小さい目と高い鼻が特徴(息子の顕家も同様)。奥州から南下して尊氏を京都から撃退したのと、亡くなったことが語られる。後者は本編ではなく、あとがきに貴族姿のイラストが人物紹介に書かれるのみ。『まんが太平記』にも白髪白髯の老人として登場。